パッケージ: megahit (1.2.9-2)

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ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

その他の megahit 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: bzip2

高品質ブロックソートファイル圧縮 - ユーティリティ
dep: libc6 (>= 2.14)

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

GCC 共有ライブラリ
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 7)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
dep: python3-all

package depending on all supported Python 3 runtime versions
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

圧縮ライブラリ - ランタイム

megahit のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1,011.9 kB	7,983.0 kB	[ファイル一覧]