パッケージ: seqmagick (0.8.4-3)

seqmagick に関するリンク

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メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

その他の seqmagick 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-pygtrie

Python library implementing a trie data structure (Python 3)

seqmagick のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
all	41.6 kB	226.0 kB	[ファイル一覧]