Package: velvet-long (1.2.10+dfsg1-5)

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Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.ebi.ac.uk]

Similar packages:

assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte, versione lunga

Velvet è un assemblatore genomico de novo progettato specificatamente per le tecnologie di sequenziamento basate su sequenze corte, come Solexa o 454, sviluppato da Daniel Zerbino e Ewan Birney all'European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), vicino a Cambridge, in Gran Bretagna.

Velvet attualmente accetta sequenze molto corte, rimuove errori e poi produce frammenti contigui unici di alta qualità. Poi usa informazioni sulle paired-read, se disponibili, per recuperare le aree ripetute tra i vari frammenti contigui.

Questo pacchetto installa versioni speciali in modalità lunga di Velvet, come raccomandato nei tutorial di Velvet.

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libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
dep: velvet

assemblatore di sequenze di acidi nucleici da sequenze molto corte
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

libreria di compressione - runtime

Download velvet-long

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	213.7 kB	1,930.0 kB	[list of files]
arm64	186.1 kB	1,690.0 kB	[list of files]
armhf	200.5 kB	1,344.0 kB	[list of files]
i386	243.9 kB	2,456.0 kB	[list of files]