Package: python-biom-format (2.1.7+dfsg-2)
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Download Source Package python-biom-format:
- [python-biom-format_2.1.7+dfsg-2.dsc]
- [python-biom-format_2.1.7+dfsg.orig.tar.xz]
- [python-biom-format_2.1.7+dfsg-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [biom-format.org]
Similar packages:
formato BIOM (Biological Observation Matrix) (Python 2)
Il formato di file BIOM (Biological Observation Matrix, matrice di osservazioni biologiche) è progettato per essere un formato di uso generico per rappresentare campioni biologici con tabelle di contingenza delle osservazioni. BIOM è uno standard riconosciuto per l'Earth Microbiome Project ed è un progetto candidato del Genomics Standards Consortium.
Il formato BIOM è progettato per l'uso generico in vaste aree delle scienze -omiche comparative. Per esempio, in indagini su geni marker, l'uso principale di questo formato è quello di rappresentare tabelle OTU: in questo caso le osservazioni sono OTU e la matrice contiene i conteggi corrispondenti al numero di volte che ogni singola OTU è stata osservata in ciascun campione. Nel caso di dati di metagenomi, questo formato può essere usato per rappresentare tabelle metagenomiche: le osservazioni in questo caso potrebbero corrispondere ai sottosistemi SEED e la matrice conterrebbe i conteggi corrispondenti al numero di volte che ogni sottosistema è stato osservato in ciascun metagenoma. Analogamente, nel caso di dati genomici, questo formato può essere usato per rappresentare un insieme di genomi: le osservazioni in questo caso corrisponderebbero ancora una volta ai sottosistemi SEED e i conteggi corrisponderebbero al numero di volte che ogni sottosistema è stato osservato in ciascun genoma.
Questo pacchetto fornisce la libreria per il formato BIOM per l'interprete Python 2.
Other Packages Related to python-biom-format
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- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64]
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- dep: pyqi
- infrastruttura Python per fare da wrapper di comandi generali in interfacce diverse
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- dep: python
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7~)
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- dep: python-click
- wrapper di optparse per utilità a riga di comando - Python 2.7
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- dep: python-future
- compatibilità con Python 3 e 2 in un singolo sorgente - Python 2.x
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- dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)
- aggiunge una veloce struttura per array al linguaggio Python
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- dep: python-numpy-abi9
- virtual package provided by python-numpy
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- dep: python-pandas
- strutture dati per dati "relazionali" o "etichettati"
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- dep: python-scipy
- strumenti scientifici per Python
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- dep: python-six (>= 1.10.0)
- libreria di compatibilità per Python 2 e 3 (interfaccia Python 2)
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- sug: python-biom-format-doc
- documentazione del formato BIOM
Download python-biom-format
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 139.9 kB | 683.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 128.5 kB | 667.0 kB | [list of files] |
| armhf | 134.0 kB | 602.0 kB | [list of files] |
| i386 | 134.1 kB | 687.0 kB | [list of files] |