Package: python3-mappy (2.17+dfsg-12 and others)

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interfaccia Python 3 per minimap2

Minimap2 è un versatile programma per l'allineamento di sequenze che allinea sequenze di DNA o mRNA rispetto a un grande database di riferimento. Casi d'uso tipici includono: (1) mappatura di letture genomiche PacBio o Oxford Nanopore con il genoma umano; (2) ricerca di sovrapposizioni tra letture lunghe con tassi di errore fino a ~15%; (3) allineamento, tenendo conto degli splice, di letture PacBio Iso-Seq o Nanopore cDNA o Direct RNA rispetto a un genoma di riferimento; (4) allineamento di letture Illumina singole o accoppiate; (5) allineamento assemblaggio-verso-assemblaggio; (6) allineamento dell'intero genoma tra due specie strettamente imparentate con divergenza sotto a ~15%.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Python 3 per usare minimap2.

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libreria di compressione - runtime

Download python3-mappy

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.17+dfsg-12+b3	127.2 kB	329.0 kB	[list of files]
arm64	2.17+dfsg-12+b3	114.0 kB	309.0 kB	[list of files]
armel	2.17+dfsg-12+b3	130.6 kB	351.0 kB	[list of files]
armhf	2.17+dfsg-12+b3	131.2 kB	259.0 kB	[list of files]
i386	2.17+dfsg-12+b3	158.7 kB	440.0 kB	[list of files]
mips64el	2.17+dfsg-12+b3	138.2 kB	392.0 kB	[list of files]
mipsel	2.17+dfsg-12+b3	151.7 kB	402.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.17+dfsg-12+b3	138.0 kB	433.0 kB	[list of files]
s390x	2.17+dfsg-12+b3	135.7 kB	401.0 kB	[list of files]