[ Source: htslib ]
Package: libhts3 (1.16+ds-3)
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External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.
HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.
Other Packages Related to libhts3
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione GnuTLS)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE
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- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Custom compression for CRAM and others
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- libreria per compressione in formato XZ
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- dep: libssl3 (>= 3.0.0)
- toolkit Secure Sockets Layer - librerie condivise
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download libhts3
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| arm64 | 382.7 kB | 1,188.0 kB | [list of files] |