Paquets logiciels dans « stretch », Sous-section science

3depict (0.0.19-1+b1)
visualisation et analyse pour des données de point à valeurs uniques
abacas (1.3.1-3)
contiguation automatique basée sur un algorithme de séquences assemblées
abinit (8.0.8-1+b1)
paquet pour les calculs de structure électronique
abyss (2.0.2-2)
assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes
acedb-other (4.9.39+dfsg.02-1)
Récupération d'ADN ou de séquences de protéines
acedb-other-belvu (4.9.39+dfsg.02-1)
éditeur d'alignement de séquences multiples
acedb-other-dotter (4.9.39+dfsg.02-1)
visualisation de similitude de séquences
aces3 (3.0.8-5.1+b1)
concepts avancés en structure électronique III
aces3-data (3.0.8-5.1)
concepts avancés en structure électronique III
achilles (2-8.2+b1)
Simulateur de vie artificielle et d'évolution
adapterremoval (2.2.0-1)
découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes
adapterremoval-examples (2.2.0-1)
découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes – données d'exemple
adun-core (0.81-9+b2)
simulateur moléculaire
aegean (0.15.2+dfsg-1)
boîte d’amalgame d’outils d'analyse de génome
aeskulap (0.2.2b1+git20161206-1)
Afficheur d'images médicales et client réseau DICOM
aevol (4.4-1+b5 [arm64], 4.4-1+b4 [amd64, armel, armhf, i386, mips, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x])
modèle numérique de génétique pour lancer des expériences d'évolution in silico
aghermann (1.1.2-1)
gestionnaire d'expérimentation de recherche sur le sommeil
alfa (1.0-2)
algorithme d'ajustement de ligne automatisé
algotutor (0.8.6-1)
programme d'observation des étapes intermédiaires d'un algorithme
alien-hunter (1.7-5)
Distribution des motifs d'ordre variable (IVOM) pour identifier l'ADN acquis par transfert horizontal
altree (1.3.1-4+b2)
programme pour faire de l'association basée sur la phylogénétique et l'analyse de localisation
altree-examples (1.3.1-4)
fichiers d'exemple pour ALTree
amap-align (2.2-6)
alignement multiple de séquences protéiques par appariement
ampliconnoise (1.29-6)
suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454
andi (0.10-2)
estimation efficace de distances d'évolution
anfo (0.98-5)
aligneur/mappeur de lectures courtes à partir de MPG
ants (2.1.0-5)
outils de normalisation élaborés pour l'analyse d'images du cerveau
aoflagger (2.9.0-1)
découverte des RFI dans les observations radioastronomiques
apbs (1.4-1+b1)
Solveur adaptatif de Poisson Boltzmann
apertium-af-nl (0.2.0~r58256-1)
données Apertium pour les traductions entre l'afrikaans et le néerlandais
apertium-apy (0.9.1~r343-2)
service APY d'Apertium
apertium-arg (0.1.2~r65494-1)
données simples Apertium pour l'aragonais
apertium-arg-cat (0.1.0~r64925-1)
données Apertium pour les traductions entre l'aragonais et le catalan
apertium-br-fr (0.5.0~r61325-2)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le breton et le français
apertium-ca-it (0.1.1~r57554-1)
données Apertium pour les traductions entre le catalan et l'italien
apertium-cat (1.0.0~r65787-1)
données simples Apertium pour le catalan
apertium-cy-en (0.1.1~r57554-3)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le gallois et l'anglais
apertium-dan (0.5.0~r67099-1)
données linguistiques simples Apertium pour le danois
apertium-dan-nor (1.3.0~r67099-1)
données Apertium pour les traductions entre le danois et le norvégien
apertium-dev (3.4.0~r61013-5+b1)
outils et bibliothèque de développement pour Apertium
apertium-en-gl (0.5.2~r57551-1)
données Apertium pour les traductions entre l'anglais et le galicien
apertium-eo-en (1.0.0~r63833-1)
données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et l'anglais
apertium-eo-fr (0.9.0~r57551-1)
données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et le français
apertium-es-ast (1.1.0~r51165-1)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'asturien
apertium-es-it (0.1.0~r51165-1)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'italien
apertium-eu-en (0.3.1~r56205-1)
données Apertium pour les traductions entre le basque et l'anglais
apertium-fra (1.0.0~r65786-1)
données simples Apertium pour le français
apertium-fra-cat (1.1.0~r64309-1)
données Apertium pour les traductions entre le français et le catalan
apertium-hbs (0.5.0~r68212-2)
données simples Apertium pour le serbo-croate
apertium-hbs-eng (0.1.0~r57598-1)
données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et l'anglais
apertium-hbs-mkd (0.1.0~r57554-1)
données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le macédonien
apertium-hbs-slv (0.1.0~r59294-1)
données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le slovénien
apertium-hin (0.1.0~r59158-1)
données simples Apertium pour le hindi
apertium-id-ms (0.1.1~r57551-1)
données Apertium pour les traductions entre l'indonésien et le malais
apertium-is-sv (0.1.0~r56030-1)
données Apertium pour les traductions entre l'islandais et le suédois
apertium-isl (0.1.0~r65494-1)
données simples Apertium pour l'islandais
apertium-isl-eng (0.1.0~r66083-1)
données Apertium pour les traductions entre l'islandais et l'anglais
apertium-ita (0.9.0~r72553-1)
données simples Apertium pour l'italien
apertium-kaz (0.1.0~r61338-1)
données simples Apertium pour le kazakh
apertium-kaz-tat (0.2.1~r57554-1)
données Apertium pour les traductions entre le kazakh et le tatar
apertium-lex-tools (0.1.1~r66150-1+b1)
module de sélection lexicale basé sur les contraintes
apertium-mk-bg (0.2.0~r49489-1)
données Apertium pour les traductions entre le macédonien et le bulgare
apertium-mk-en (0.1.1~r57554-1)
données Apertium pour les traductions entre le macédonien et l'anglais
apertium-mlt-ara (0.2.0~r62623-1)
données Apertium pour les traductions entre le maltais et l'arabe
apertium-nno (0.9.0~r69513-1)
données linguistiques simples Apertium pour le norvégien Nynorsk
apertium-nno-nob (1.1.0~r66076-1)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le norvégien Nynorsk et le norvégien Bokmål
apertium-nob (0.9.0~r69513-1)
données linguistiques simples Apertium pour le norvégien Bokmål
apertium-sme-nob (0.6.0~r61921-1)
données Apertium pour les traductions entre le sámi et le bokmål
apertium-spa (0.1.0~r65494-1)
données simples Apertium pour l'espagnol
apertium-spa-arg (0.4.0~r64399-1)
données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'aragonais
apertium-srd (0.9.0~r72792-1)
données simples Apertium pour le sarde
apertium-srd-ita (0.9.0~r72554-1)
données Apertium pour les traductions entre le sarde et l'italien
apertium-swe (0.7.0~r69513-1)
données linguistiques Apertium pour le suédois uniquement
apertium-swe-dan (0.7.0~r66063-1)
données linguistiques Apertium pour les traductions entre le suédois et le danois
apertium-tat (0.1.0~r60887-1)
données simples Apertium pour le tatar
apertium-urd (0.1.0~r61311-1)
données simples Apertium pour l'ourdou
apertium-urd-hin (0.1.0~r64379-1)
données Apertium pour les traductions entre l'ourdou et le hindi
aragorn (1.2.38-1)
détection ARNt et ARNtm dans les séquences de nucléotides
arb (6.0.6-1) [non-free]
phylogenetic sequence analysis suite - main program
arb-common (6.0.6-1) [non-free]
phylogenetic sequence analysis suite - common files
arden (1.0-3)
contrôle de spécificité pour les alignements de lecture utilisant une référence artificielle
ariba (2.6.1+ds-1)
identification de résistance antibiotique par assemblage
art-nextgen-simulation-tools (20160605+dfsg-2)
outils de simulation pour créer des lectures de séquençage synthétiques de nouvelle génération
art-nextgen-simulation-tools-profiles (20160605+dfsg-2)
profils pour les outils de simulation ART
artemis (16.0.17+dfsg-1)
navigateur de génome et outil d'annotation
artfastqgenerator (0.0.20150519-2)
création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence
artfastqgenerator-examples (0.0.20150519-2)
création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence – exemples
asdftool (1.2.1-2)
outil en ligne de commande pour manipuler les fichiers de données scientifiques ASDF
ask (1.1.1-1)
kit d'échantillonage pour grands espaces expérimentaux
astro-tasks (1.0)
mélange exclusif Debian Astronomy (tâches de tasksel)
astromatic (1.1)
collection logicielle d'infrastructure astronomique
astrometry-data-2mass (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader
astrometry-data-2mass-00 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (2'-2.8')
astrometry-data-2mass-01 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (2.8'-4')
astrometry-data-2mass-02 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (4'-5.6')
astrometry-data-2mass-03 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (5.6'-8')
astrometry-data-2mass-04 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (8'-11')
astrometry-data-2mass-05 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (11'-16')
astrometry-data-2mass-06 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (16'-22')
astrometry-data-2mass-07 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (22'-30')
astrometry-data-2mass-08-19 (1.1) [contrib]
Astrometry.net 2MASS index files downloader (30'-2000')
astrometry-data-tycho2 (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net
astrometry-data-tycho2-07 (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
astrometry-data-tycho2-07-bigendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
astrometry-data-tycho2-07-littleendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
astrometry-data-tycho2-08 (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
astrometry-data-tycho2-08-bigendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
astrometry-data-tycho2-08-littleendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
astrometry-data-tycho2-09 (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
astrometry-data-tycho2-09-bigendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
astrometry-data-tycho2-09-littleendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
astrometry-data-tycho2-10-19 (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
astrometry-data-tycho2-10-19-bigendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
astrometry-data-tycho2-10-19-littleendian (2-3)
fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
astrometry.net (0.70+dfsg-1)
solveur de plaque photographique astrométrique
astronomical-almanac (5.6-4+b2)
almanach astronomique - calcul de positions d'étoiles et de planètes
astropy-utils (1.3-8)
outils en ligne de commande d'astropy
atac (0~20150903+r2013-3)
comparaison de génomes d'assemblage en assemblage
augustus (3.2.3+dfsg-1)
prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
augustus-data (3.2.3+dfsg-1)
fichiers de données pour AUGUSTUS
autodock (4.2.6-3+b1)
Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine
autodock-getdata (4.2.6-3)
instructions pour collecter des données pour getData
autodock-test (4.2.6-3)
fichiers de test pour AutoDock
autodock-vina (1.1.2-3+b6 [amd64], 1.1.2-3+b5 [armel, armhf, i386, mips, mipsel, s390x], 1.1.2-3+b4 [arm64, ppc64el], 1.1.2-3+b2 [mips64el])
chargement de petites molécules jusqu'aux protéines
autogrid (4.2.6-3+b1)
Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur
autogrid-test (4.2.6-3)
fichiers de test pour AutoGrid
avce00 (2.0.0-5)
conversion de couverture vectorielle Arcinfo d’ESRI (binaire) au format E00
avogadro (1.2.0-1+deb9u1)
système de modélisation et d'imagerie moléculaire
avogadro-data (1.2.0-1+deb9u1)
système de modélisation et d'imagerie moléculaire –⋅fichiers de données
aweather (0.8.1-1.1)
programme évolué de surveillance de la météo
axe-demultiplexer (0.3.2+dfsg1-1)
démultiplexeur de lecture de séquence ADN basé sur les arbres préfixes
bagel (0.0~git20170109-1)
paquet de chimie computationnelle
bagel-data (0.0~git20170109-1)
paquet de chimie computationnelle – fichiers de données
ballview (1.4.3~beta1-3)
modélisation moléculaire (libre) et outil graphique moléculaire
bamtools (2.4.1+dfsg-1)
boîte à outils de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
barrnap (0.7+dfsg-2)
prédiction ribosomale rapide d'ARN
bart (0.4.00-1)
outils pour l'imagerie par résonance magnétique computationnelle
bauble (0.9.7-2.1)
application de gestion de collection de biodiversité
bcftools (1.3.1-1+b1)
appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF
beagle (4.1~160727-86a+dfsg-1)
appel de génotype, phasage de génotype et attribution de marqueurs non génotypés
beast-mcmc (1.8.4+dfsg.1-1)
inférence phylogénétique bayésienne MCMC
beast2-mcmc (2.4.4+dfsg-1)
inférence phylogénétique bayésienne MCMC
bedtools (2.26.0+dfsg-3)
suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
bedtools-test (2.26.0+dfsg-3)
données de test pour le paquet bedtools
berkeley-express (1.5.1-3+b1)
quantification de streaming pour le séquençage à taux élevé
bibus (1.5.2-4)
base de données bibliographiques
bio-eagle (2.3-3)
phasage d'haplotype au sein d'une cohorte génotypée ou grâce à un panel phasé de référence
bio-eagle-examples (2.3-3)
exemples pour bio-eagle
bio-rainbow (2.0.4-1+b1)
partitionnement et assemblage de séquences courtes pour la bio-informatique
biogenesis (0.8-2)
programme de vie artificielle pour simuler l’évolution d’organismes
biomaj (1.2.3-11)
système de mise à jour de banques de données biologiques
biomaj-properties (1.2.3-11)
actualiseur de banque de données biologiques − exemples de fichiers de propriétés
biomaj-watcher (1.2.2-4+deb9u1) [contrib]
biological data-bank updater - web interface
bioperl (1.7.1-2)
outils en Perl pour la bio-informatique
bioperl-run (1.7.1-3)
scripts d'enveloppe BioPerl
biosig-tools (1.3.0-2.2)
outils de conversion entre différents formats de données médicales
biosquid (1.9g+cvs20050121-7)
utilitaire d'analyse de séquences biologiques
bist (0.5.2-1.1+b1)
outil de dessin chimique
bkchem (0.13.0-5)
éditeur de structures chimiques
blasr (5.3+0-1)
correspondance de lectures de séquençage de molécules simples
blast2 (1:2.6.0-1)
paquet factice de transition vers ncbi-blast+-legacy
blimps-utils (3.9-1) [non-free]
blocks database improved searcher
bmt (0.6-1)
boîte à outils de mesure de performances d'analyse logicielle
bodr (10-1)
dépôt de données Blue Obelisk
boinc-app-seti (8.00~svn3363-3)
application SETI@home pour le client BOINC
boinc-app-seti-graphics (8.00~svn3363-3)
application SETI@home pour le client BOINC − interface graphique
boolector (1.5.118.6b56be4.121013-1+b1)
solveur SMT pour les vecteurs de bits et les tableaux
bowtie (1.1.2-6)
aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
bowtie-examples (1.1.2-6)
exemples pour bowtie, l'aligneur de lectures courtes ultra rapide et efficace en mémoire
bowtie2 (2.3.0-2)
aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
bowtie2-examples (2.3.0-2)
exemples pour bowtie2
boxshade (3.3.1-10)
Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
bppphyview (0.3.0-1.1+b1)
afficheur phylogénétique pour Bio++
bppsuite (2.2.0-0.1+b1)
suite de programmes Bio++
brig (0.95+dfsg-1)
générateur d'images circulaires BLAST
bwa (0.7.15-2+deb9u1)
dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
cafeobj (1.5.5-1+b1)
langage de spécification et programmation algébrique de nouvelle génération
cafeobj-mode (1.5.5-1)
mode majeur Emacs pour modifier du code source CafeOBJ
caffe-cpu (1.0.0~rc4-1)
cadriciel ouvert et rapide d'apprentissage profond –⋅méta-paquet
caffe-tools-cpu (1.0.0~rc4-1)
outils pour le cadriciel ouvert et rapide d'apprentissage profond –⋅CPU_ONLY
caffe-tools-cuda (1.0.0~rc4-1) [contrib]
Tools for fast, open framework for Deep Learning (CUDA)
cain (1.10+dfsg-2)
simulations de réactions chimiques
cain-examples (1.10+dfsg-2)
exemples pour cain
cain-solvers (1.10+dfsg-2)
solveurs pour cain
calculix-ccx (2.11-1+b1)
programme d'éléments finis structurels en trois dimensions
calculix-cgx (2.11+dfsg-1+b1)
pré et postprocesseur tridimensionnel pour les modèles à éléments finis
camitk-actionstatemachine (4.0.4-2)
application pour rejouer les flux d'actions pour la bibliothèque CamiTK
camitk-config (4.0.4-2)
boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – configuration
camitk-imp (4.0.4-2)
banc de test pour la bibliothèque CamiTK
casacore-data-igrf (10-1)
données de champ de référence géomagnétique international pour casacore
casacore-data-lines (0+git2016.11.26-2)
table de fréquences de ligne spectrale pour casacore
casacore-data-observatories (0+git2016.11.02-1)
table des coordonnées d'observatoires radio
casacore-data-sources (2-2)
table de coordonnées de sources de référence ICRF2 pour casacore
casacore-data-tai-utc (1.1)
table de différente entre TAI et UTC pour casacore
casacore-tools (2.2.0-2)
outils construits avec CASA
cassbeam (1.1-1+b1)
modélisation des antennes Cassegrain
cassiopee (1.0.5-1+b1 [amd64], 1.0.5-1 [arm64, armel, armhf, i386, mips, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x])
outil d'indexation et de recherche dans les séquences génomiques
cba (0.3.6-4.1+b2)
analyse de rayon continu
cbflib-bin (0.9.2.2-1+b1)
utilitaires de manipulation de fichiers CBF
cbmc (5.6-1)
vérificateur de modèle borné pour les programmes C et C++
cclib (1.3.1-1)
analyseurs et algorithmes pour la chimie computationnelle
cclib-data (1.1-1) [non-free]
Parsers and algorithms for computational chemistry (data files)
cd-hit (4.6.6-2)
suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
cdbfasta (0.99-20100722-3)
indexation avec Constant DataBase et outils de recherche pour les fichiers multi-FASTA
cernlib (20061220+dfsg3-4.3+deb9u2)
suite d'analyse de données CERNLIB -- méta-packet pour usage général
cernlib-core (20061220+dfsg3-4.3+deb9u2)
suite d'analyse de données CERNLIB — bibliothèques et programmes principaux
cernlib-extras (20061220+dfsg3-4.3+deb9u2)
suite d'analyse de données CERNLIB — programmes supplémentaires
cernlib-montecarlo (20061220+dfsg3-3.1)
bibliothèques Monte Carlo CERNLIB
cg3 (0.9.9~r11624-1+b3)
outils pour utiliser la troisième édition de Constraint Grammar (CG-3)
cgns-convert (3.3.0-4)
système de notation générale CFD — outils de conversion
cgview (0.0.20100111-2)
visionneuse de génome circulaire
ch5m3d (1.2.5+dfsg-1)
création et visualisation de dessins en 3D de molécules simples
chemical-structures (2.2.dfsg.0-12)
jeu de structures moléculaires dans des formats ouverts
chemps2 (1.8.3-2)
exécutable pour appeler libchemps2-2 depuis la ligne de commande
chemtool (1.6.14-1+b1)
programme de dessin de structures chimiques
chimeraslayer (20101212+dfsg1-1)
détecte les simili-chimères dans les ADN amplifiés via réaction en chaîne par polymérase
circlator (1.4.1-1)
circularisation d'assemblages de génomes
circos (0.69.4+dfsg-1)
outil de dessin pour visualiser des données
circos-tools (0.22-1)
Traceur pour visualisation de données — utilitaires auxiliaires
ckon (0.7.1-3+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips, mipsel, ppc64el, s390x], 0.7.1-3+b2 [mips64el])
outil de compilation automatique pour le logiciel d'analyse de données ROOT
clearcut (1.0.9-1+b1)
reconstruction d'arbre phylogénétique extrêmement efficace
clonalframe (1.2-5)
inférence de microévolution bactérienne en utilisant des données de séquence multilocus
clustalo (1.2.4-1)
programme à usage général d'alignement de plusieurs séquences pour les protéines
clustalw (2.1+lgpl-5)
alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
clustalx (2.1+lgpl-5)
alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
cluster3 (1.52a-1) [non-free]
Reimplementation of the Eisen-clustering software
cmor-tables (3.2-1)
tables MIP pour la bibliothèque de réécriture de sortie de modèle de climat
cmtk (3.3.1-1.1)
boîte à outils de morphométrie computationnelle
code-aster-gui (1.13.1-2)
interface graphique pour Code_Aster – client
code-aster-run (1.13.1-2)
interface graphique pour Code_Aster - serveur
code-saturne (4.3.3+repack-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD)
code-saturne-bin (4.3.3+repack-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD) – exécutables
code-saturne-data (4.3.3+repack-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – données
code-saturne-doc (4.3.3+repack-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – documentation
code-saturne-include (4.3.3+repack-1)
logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – fichiers d'inclusion
codonw (1.4.4-3+b1)
analyse de correspondance d'utilisation de codon
coinor-cbc (2.8.12-1+b2)
solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR
coinor-clp (1.15.10-3+b1)
solveur de programmation linéaire COIN-OR
coinor-csdp (6.1.1-1+b2)
paquet de programmation semi-définie
coinor-libcbc3 (2.8.12-1+b2)
solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR – bibliothèques partagées
coinor-libcgl1 (0.58.9-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips, mipsel, ppc64el, s390x], 0.58.9-1 [mips64el])
bibliothèque de génération de coupes COIN-OR
coinor-libclp1 (1.15.10-3+b1)
solveur de programmation linéaire COIN-OR – bibliothèques partagées
coinor-libcoinutils3v5 (2.9.15-4)
collection de classes utilitaires de COIN-OR – exécutables et bibliothèques
coinor-libflopc++0 (1.0.6-3.1+b2 [amd64, armel, armhf, i386, mips, mipsel, s390x], 1.0.6-3.1+b1 [ppc64el], 1.0.6-3.1 [arm64, mips64el])
formulation de problèmes d’optimisation linéaire en C++
coinor-libosi1v5 (0.106.9-2+b1)
interface de solveur ouverte COIN-OR
coinor-libsymphony3 (5.6.1-1+b2)
solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes – bibliothèques partagées
coinor-symphony (5.6.1-1+b2)
solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes
comet-ms (2014022-3+b2)
moteur de recherche de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)
concavity (0.1+dfsg.1-1)
prédicteur de sites de liaisons de ligands de la protéine à partir de la structure et de la conservation
connectome-workbench (1.2.3+git3-g7b83782-1)
outil de visualisation du cerveau, d'analyse et de découverte
conservation-code (20110309.0-5)
outil de notation de la conservation des séquences de protéines
cp2k (4.1-1+b1)
Ab Initio Molecular Dynamics
cp2k-data (4.1-1)
Ab Initio Molecular Dynamics (data files)
cpl-plugin-amber (4.3.4+dfsg-1+b1)
ESO data reduction pipeline for the AMBER instrument
cpl-plugin-amber-calib (4.3.4+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for AMBER
cpl-plugin-fors (5.3.11+dfsg-1)
ESO data reduction pipeline for the FORS1/2 instruments
cpl-plugin-fors-calib (5.3.11+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for FORS2
cpl-plugin-giraf (2.15+dfsg-1+b1)
ESO data reduction pipeline for the GIRAFFE instrument
cpl-plugin-giraf-calib (2.15+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for GIRAFFE
cpl-plugin-hawki (1.8.21+dfsg-1)
ESO data reduction pipeline for the HAWK-I instrument
cpl-plugin-hawki-calib (1.8.21+dfsg-1)
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for HAWK-I
cpl-plugin-kmos (1.4.0+dfsg-1)
ESO data reduction pipeline for the KMOS instrument
cpl-plugin-kmos-calib (1.4.0+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for KMOS
cpl-plugin-muse (1.6.2+dfsg-1)
ESO data reduction pipeline for the MUSE instrument
cpl-plugin-muse-calib (1.6.2+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for MUSE
cpl-plugin-naco (4.4.1+dfsg-3)
ESO data reduction pipeline for the NaCo instrument
cpl-plugin-naco-calib (4.4.1+dfsg-3) [contrib]
ESO data reduction pipeline NaCo calibration data downloader
cpl-plugin-uves (5.7.0+dfsg-1+b1)
ESO data reduction pipeline for the UVES instrument
cpl-plugin-uves-calib (5.7.0+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for UVES
cpl-plugin-vimos (3.1.7+dfsg-1+b1)
ESO data reduction pipeline for the VIMOS instrument
cpl-plugin-vimos-calib (3.1.7+dfsg-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VIMOS
cpl-plugin-visir (4.3.0+dfsg1-1+b1)
ESO data reduction pipeline for the VISIR instrument
cpl-plugin-visir-calib (4.3.0+dfsg1-1) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VISIR
cpl-plugin-xshoo (2.8.4+dfsg-3)
ESO data reduction pipeline for the XSHOOTER instrument
cpl-plugin-xshoo-calib (2.8.4+dfsg-3) [contrib]
ESO data reduction pipeline calibration data downloader for XSHOOTER
crac (2.5.0+dfsg-1)
integrated RNA-Seq read analysis
critterding (1.0-beta12.1-1.3+b1)
évolution de la vie artificielle
ctsim (5.2.0-4)
Simulateur de tomographie calculée
ctsim-help (5.2.0-4)
fichier d’aide en ligne pour CTSim
cufflinks (2.2.1-3+b1) [non-free]
Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
cutadapt (1.12-2)
Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads
cwltool (1.0.20170114120503-1)
Common workflow language reference implementation
daligner (1.0+20161119-1)
alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide
dans-gdal-scripts (0.24-1+b1)
outils de contribution à GDAL du Réseau d’information géographique d’Alaska
dascrubber (0~20160601-2)
alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
datalad (0.4.1-1)
data files crawler and data distribution
dawg (1.2-1+b1)
program to simulate the evolution of recombinant DNA sequences
dazzdb (1.0+20161112-2)
manage nucleotide sequencing read data
dcm2niix (1.0.20161101-1)
convertisseur de dernière génération DICOM vers NIfTI
dcmtk (3.6.1~20160216-4)
utilitaires en ligne de commande de la boîte à outils OFFIS DICOM
(1.0)
logo du mélange exclusif Debian Astronomie
dh-r (20161219)
outils d’aide de Debian pour empaqueter les bibliothèques R
dialign (2.2.1-8)
alignement de plusieurs séquences par segments
dialign-tx (1.0.2-9)
alignement séquentiel multiple basé sur les segments
dialign-tx-data (1.0.2-9)
alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données
dicomnifti (2.32.1-1+b1)
Convertit les fichiers DICOM au format NIfTI
dicompyler (0.4.2-3)
plate-forme de recherche en radiothérapie
dimbl (0.15-1)
apprentissage automatique distribué
dindel (1.01+dfsg-4+b1)
determines indel calls from short-read data
discosnp (1.2.6-1+b2)
discovering Single Nucleotide Polymorphism from raw set(s) of reads
disulfinder (1.2.11-6)
prédiction de pont disulfure et de leur connectivité
disulfinder-data (1.2.11-6)
fichiers de données pour la prédiction de pont disulfure dans les protéines
dnaclust (3-4+b2)
outil de regroupement de millions de séquences courtes d’ADN
doris (4.06~beta2+dfsg-3+b1) [contrib]
Delft object-oriented radar interferometric software
dozzaqueux (3.50-1+b1)
simulateur pour des mélanges chimiques
dozzaqueux-data (3.50-1)
databases for chemical mixtures
dpuser (3.3+p1+dfsg-2)
Interactive language for handling numbers, strings, and matrices
drawxtl (5.5-3+b2)
visionneur de structures cristallographiques
drslib (0.3.0a3-5)
Command-line tools for the Data Reference Syntax library
dsdp (5.8-9.4)
logiciel pour la programmation semi-définie positive
dssp (2.2.1-3+b2)
affectation de la structure secondaire de la protéine basée sur la structure en 3D
dwgsim (0.1.11-3+b1)
short sequencing read simulator
dx (1:4.4.4-9+b1)
OpenDX (IBM Visualization Data Explorer) : paquet principal
dxsamples (4.4.0-3)
Programmes d'exemples pour OpenDX Data Explorer
e00compr (1.0.1-3)
programme de lecture et écriture de fichiers compressés E00 d’Arcinfo
ea-utils (1.1.2+dfsg-4)
command-line tools for processing biological sequencing data
easychem (0.6-8+b1)
trace des molécules et des formules chimiques 2D de haute qualité
ecaccess (4.0.1-1)
clients to access ECMWF facilities
ecopcr (0.5.0+dfsg-1)
estimate PCR barcode primers quality
edfbrowser (1.58-1+b1)
visualisateur pour les fichiers de stockage biomédicaux tels que BDF et EDF
edtsurf (0.2009-4+b1 [amd64], 0.2009-4 [arm64, armel, armhf, i386, mips, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x])
surfaces de maillage triangulaire pour les structures de protéines
eficas (6.4.0-1-1.2)
éditeur graphique de fichiers de commandes Code_Aster
eigensoft (6.1.4+dfsg-1+b1)
reduction of population bias for genetic analyses
elastix (4.8-10+b1)
Boîte à outils pour le recalage rigide et non-rigide d'images
elk-lapw (4.0.15-2+b1)
All-Electron Density-Functional Electronic Structure Code
elki (0.7.1-3)
cadriciel de développement pour des algorithmes d’exploration de données
elki-dev (0.7.1-3)
Data mining algorithm development framework - development files
embassy-domainatrix (0.1.660-1)
commandes supplémentaires EMBOSS pour manipuler un fichier de classification de domaines
embassy-domalign (0.1.660-1)
commandes EMBOSS additionnelles pour l'alignement dans le domaine des protéines
embassy-domsearch (1:0.1.660-1)
commandes supplémentaires EMBOSS pour la recherche dans les domaines de la protéine
embassy-phylip (3.69.660-1) [non-free]
EMBOSS conversions of the programs in the phylip package
emboss (6.6.0+dfsg-6)
ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
emboss-data (6.6.0+dfsg-6)
data files for the EMBOSS package
emboss-explorer (2.2.0-8)
interface web graphique pour EMBOSS
emboss-lib (6.6.0+dfsg-6)
EMBOSS Libraries
engauge-digitizer (9.7+ds.1-1)
extraction interactive des valeurs depuis des images bitmap ou des cartes
ent (1.2debian-1+b1)
programme de test de séquences de nombres pseudo-aléatoires
epigrass (2.4.7-1)
Outil scientifique pour la simulation et l'analyse de sénarios dans des réseaux épidémiologiques
epsilon-bin (0.9.2+dfsg-2)
bibliothèque pour la compression par ondelettes – outils
ergo (3.5-1+b1)
Quantum chemistry program for large-scale calculations
eso-midas (15.09pl1.0-2+b2)
ESO-Midas (European Southern Observatory — Munich Image Data Analysis System)
eso-pipelines (1.2)
ESO VLT Instrument pipeline collection
esorex (3.12.3-1+b2)
outils d’exécution pour des automatismes de l’Observatoire européen austral
esys-particle (2.3.4+dfsg1-4)
Software for particle-based numerical modelling. MPI version.
etsf-io (1.0.4-1.1+b1)
Binary tools to check, merge and read ETSF files
exonerate (2.4.0-2)
outil générique pour la comparaison de deux séquences
expeyes (4.2.1+dfsg-1)
infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
expeyes-clib (4.2.1+dfsg-1)
infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
falcon (1.8.6-1.1)
diploid-aware genome assembly of single-molecule sequencing reads
fastahack (0.0+20160702-1+b1)
utility for indexing and sequence extraction from FASTA files
fastaq (3.14.0-1)
outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
fastdnaml (1.2.2-11+b1)
outil pour la construction d'arbres phylogénétiques de séquences d'ADN
fastlink (4.1P-fix100+dfsg-1+b1)
version plus rapide des programmes de généalogie génétique Linkage
fastml (3.1-3)
maximum likelihood ancestral amino-acid sequence reconstruction
fastqc (0.11.5+dfsg-6)
contrôle qualité pour les données de séquences à haut débit
fastqtl (2.184+dfsg-5)
mappage de LCQ (locus de caractères quantitatifs) dans cis pour les phénotypes moléculaires
fasttree (2.1.9-1)
arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
fastx-toolkit (0.0.14-3)
outils de prétraitement des lectures de nucléotides courts aux formats FASTQ/A
fcc (2.8-1+b1)
Script to compile C/C++ programs and link to Fortran libraries
feedgnuplot (1.40-1)
frontal pour Gnuplot orienté tuyauterie (pipe)
ffindex (0.9.9.7-3)
index/base de données simple pour d'énormes quantités de petits fichiers
figtree (1.4.2+dfsg-2)
visionneuse d'arbres phylogénétiques sous forme graphique
filo (1.1.0-3+b1)
opérations sur les fichiers et les flux
fitgcp (0.0.20150429-1)
fitting genome coverage distributions with mixture models
fitscut (1.4.4-4+b3)
Extract cutouts from FITS image format files
fitsh (0.9.2-1+b1)
Software package for astronomical image processing
fitspng (0.3.5-1+b1)
FITS to PNG converter
fitsverify (4.18-1+b1)
FITS File Format-Verification Tool
fityk (1.3.0-1)
ajustement de courbes et analyse de données non linéaires d’usage général
flexbar (2.50-2+b1)
code-barres flexible et suppression de l'adaptation pour les plateformes de séquençage
flextra (5.0-6)
Trajectory model for tracing air transport phenomena
fml-asm (0.1-2+b1)
tool for assembling Illumina short reads in small regions
foma-bin (0.9.18+r243-1+b2)
Xerox-compatible finite-state compiler - library
form (4.1-1)
système de manipulation symbolique
fractalnow (0.8.1-1.1+b1)
générateur rapide et avancé de fractales
(1.4.77-1.2)
Free42 est une réimplémentation du calculateur HP-42S
freecad (0.16+dfsg2-3)
Extensible Open Source CAx program (alpha)
freecontact (1.0.21-5)
fast protein contact predictor
freediams (0.9.4-1+b1)
assistant de prescription et gestionnaire d'interactions médicamenteuses
freemedforms-common-resources (0.9.4-1)
données communes pour les applications du projet FreeMedForms
freemedforms-emr (0.9.4-1+b1)
gestionnaire de dossiers patients
freemedforms-emr-resources (0.9.4-1)
données pour FreeMedForms EMR
freemedforms-freedata (0.9.4-1)
données libres du projet FreeMedForms
freemedforms-libs (0.9.4-1+b1)
bibliothèques communes du projet FreeMedForms
freemedforms-project (0.9.4-1)
FreeMedForms project
freemedforms-theme (0.9.4-1)
thème pour le projet FreeMedForms
frog (0.13.7-1)
tagger and parser for natural languages (runtime)
frogdata (0.13-1)
Data files for Frog
fsa (1.15.9+dfsg-3)
Fast Statistical Alignment of protein, RNA or DNA sequences
fsm-lite (1.0-2)
frequency-based string mining (lite)
ftools-fv (5.4+dfsg-2)
outil pour afficher et éditer des fichiers au format FITS
ftools-pow (5.4+dfsg-2+b1)
Curve plotting and image display interface tool
funtools (1.4.7-1)
Minimal buy-in FITS utility package
fxt-tools (0.3.2-2+b1)
bibliothèque de traçage multifil
g3data (1:1.5.3-2.1+b1)
Extrait les données depuis des graphiques numérisés
gabedit (2.4.8-3+b1)
interface utilisateur graphique pour paquets Ab Initio
galileo (0.5.1-4)
utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit avec le service web de Fitbit
galileo-daemon (0.5.1-4)
utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit – démon
gamgi (0.17.1-1+b1)
interface graphique de modélisation atomique générale (GAMGI)
gamgi-data (0.17.1-1)
General Atomistic Modelling Graphic Interface (data)
garli (2.1-1)
phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood
garli-examples (2.1-1)
phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (examples)
garlic (1.6-1.1+b2)
Logiciel de visualisation de biomolécules
gasic (0.0.r19-1)
genome abundance similarity correction
gausssum (3.0.1.1-1)
analyse et affichage de sorties Gaussian, GAMESS…
gazebo7 (7.3.1+dfsg-3)
simulateur de robots au source ouvert – exécutables
gazebo7-common (7.3.1+dfsg-3)
simulateur de robots au source ouvert – fichiers communs
gazebo7-plugin-base (7.3.1+dfsg-3)
simulateur de robots au source ouvert – greffons de base
gbrowse (2.56+dfsg-2)
navigateur de génome générique GMOD
gbrowse-calign (2.56+dfsg-2)
outil auxiliaire CAlign
gbrowse-data (2.56+dfsg-2)
données d’échantillon pour utiliser GBrowse
gbutils (5.6.8-1+b1)
utilities for command line econometrics
gchempaint (0.14.15-1+deb9u1)
éditeur 2D de structures chimiques pour le bureau GNOME2
gcrystal (0.14.15-1+deb9u1)
visualiseur léger de structures cristallines
gcu-bin (0.14.15-1+deb9u1)
outils GNOME pour la chimie – applications auxiliaires
gcx (1.3-1.1+b2)
application en Gtk+ de traitement d’images astronomiques et de photométrie
gdal-bin (2.1.2+dfsg-5+deb9u1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386], 2.1.2+dfsg-5 [mips, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x]) [security]
Bibliothèque d'abstraction de données géospatiales - outils
gdis (0.90-5+b1)
visualisateur de modèle de molécule et de cristal
gdis-data (0.90-5)
visualisateur de modèle de molécule et de cristal — fichiers de données
gdl-astrolib (2016.11.10+dfsg-1)
Low-level astronomy software for GDL
gdl-coyote (2016.11.13-1)
GDL library from D. Fannings IDL courses
gdl-mpfit (1.84+2016.05.19-1)
Robust non-linear least squares curve fitting for GDL
gdpc (2.2.5-6)
Visualisateur de simulations de dynamique moléculaire
gdpc-examples (2.2.5-6)
fichiers d’exemples pour le programme gdpc
geant321 (1:3.21.14.dfsg-11)
outil de description et de simulation de détecteur de particules
geant321-data (1:3.21.14.dfsg-11)
données pour le simulateur de détecteur GEANT 3.21
gelemental (1.2.0-10+b1)
visionneuse de tableau périodique des éléments
genometools (1.5.9+ds-4)
boîte à outils polyvalente d'analyse du génome
genometools-common (1.5.9+ds-4)
shared data files for GenomeTools
gentle (1.9+cvs20100605+dfsg1-5)
ensemble de logiciels pour planifier le clonage génétique
geographiclib-tools (1.46-2+b1)
bibliothèque C++ pour résoudre des problèmes géodésiques –⋅outils
geotiff-bin (1.4.2-2+b1)
bibliothèque GeoTIFF (geografic enabled TIFF) – outils
gerris (20131206+dfsg-17)
solveur hydrodynamique Gerris
getdata (0.2-1)
management of external databases
gff2aplot (2.0-8+b1)
tracés d'alignements par paires pour les séquences génomiques avec PostScript
gff2ps (0.98d-5)
Produit des graphiques PostScript à partir de fichiers GFF
gfsview (20121130+dfsg-4)
visualisateur graphique de fichiers de simulation avec Gerris
gfsview-batch (20121130+dfsg-4)
batch-version of viewer for Gerris simulation files
ghkl (5.0.0.2173-2)
application de contrôle de calculs de diffractomètre
giella-core (0.1.1~r129227+svn121148-1)
GTCORE files for building Giellatekno language packages
giella-sme (0.0.20150917~r121176-1)
Giellatekno single language data for North Saami
giella-sme-dev (0.0.20150917~r121176-1)
Giellatekno single language data for North Saami (dev extras)
giira (0.0.20140625-1)
RNA-Seq driven gene finding incorporating ambiguous reads
ginga (2.6.1-2)
Astronomical image viewer
ginkgocadx (3.8.4-1)
logiciel d’imagerie médicale et visualisateur DICOM complet
glam2 (1064-3+b1)
motifs de protéines lacunaires de séquences non alignées
gliese (3.0.95-2) [non-free]
stellar data set from the Third Catalogue of Nearby Stars
glueviz (0.9.1+dfsg-1)
Linked data visualization
gmap (2017-01-14-1) [non-free]
alignement d’épissage et tolérante sur les SNP pour les lectures courtes et mNRA
gmt (5.3.1+dfsg-2+b1)
outils de cartographie générique
gmt-common (5.3.1+dfsg-2)
Generic Mapping Tools - Architecture-independent files
gmt-dcw (1.1.2-2)
Digital Chart of the World (DCW) for GMT
gmt-gshhg (2.3.6-2)
Global Self-consistent Hierarchical High-resolution Geography (GSHHG)
gmt-gshhg-full (2.3.6-2)
Full resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
gmt-gshhg-high (2.3.6-2)
High resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
gmt-gshhg-low (2.3.6-2)
Low resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
gnuastro (0.2.33-1)
GNU Astronomy Utilities programs
gpaw (1.1.0-1+b2)
DFT and beyond within the projector-augmented wave method
gpaw-data (0.9.20000-1)
gpaw datasets/setups
gperiodic (2.0.10-7+b1)
Table périodique des éléments
gpx (2.5.2-1+b1)
post-traitement de conversion gcode vers x3g
gpx2shp (0.71.0-4+b1)
Convertit les fichiers GPS ou GPX en fichiers de formes ESRI
gr-fcdproplus (3.7.25.4b6464b-2+b2)
Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio
graphlan (1.1-2)
circular representations of taxonomic and phylogenetic trees
grass (7.2.0-2)
système de gestion et d’analyse de ressources géographiques – SIG GRASS
grass-core (7.2.0-2)
composants centraux du SIG GRASS
grass-gui (7.2.0-2)
interfaces utilisateur graphiques pour le SIG GRASS
gravit (0.5.1+dfsg-2+b2)
simulateur de gravité à couper le souffle
gravit-data (0.5.1+dfsg-2)
fichiers de données pour Gravit
gri (2.12.23-10)
langage pour l'illustration scientifique
grinder (0.5.4-1)
simulateur polyvalent de lecture de séquençage global et d'amplicon omiques
gromacs (2016.1-2)
Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation
gromacs-data (2016.1-2)
GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation
gromacs-mpich (2016.1-2)
simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec MPICH
gromacs-openmpi (2016.1-2)
simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec OpenMPI
gubbins (2.2.0-1)
phylogenetic analysis of genome sequences
gvb (1.4-1)
visual simulator of 1 and 2-dimensional vibrations
gwama (2.2.2+dfsg-1)
Genome-Wide Association Meta Analysis
gwyddion (2.47-1)
outil d'analyse et de visualisation de données SPM (« Scanning Probe Microscopy »)
gwyddion-common (2.47-1)
fichiers indépendants de l’architecture pour Gwyddion, outil d’analyse SPM
gwyddion-plugins (2.47-1)
greffons pour l’outil d’analyse SPM de Gwyddion
gyoto (1.2.0-2)
intégration et lancer de rayons pour des géodésiques de relativité générale
gyoto-bin (1.2.0-2)
General relativistic ray-tracing command-line interface
h5utils (1.12.1-6+b1)
outils de visualisation de fichiers HDF5
harminv (1.4-1+b2)
extraction of complex frequencies and amplitudes from time series
harvest-tools (1.3-1)
archivage et post-traitement d’alignements multiples génomiques « reference-compressed »
hdf-compass (0.6.0-1)
visualisateur pour les formats HDF5 et apparentés
hdf5-helpers (1.10.0-patch1+docs-3+deb9u1)
HDF5 (Hierarchical Data Format 5) – assistants
hdf5-tools (1.10.0-patch1+docs-3+deb9u1)
Format de données hiérarchique 5 (HDF5) - outils d'exécution
herisvm (0.7.0-1)
machine learning tools for classification algorithms
hfst (3.10.0~r2798-3)
Helsinki Finite-State Transducer Technology
hfst-ospell (0.4.0~r4643-4+b2)
Spell checker library and tool based on HFST
hhsuite (3.0~beta2+dfsg-3)
recherche de séquence de protéines basée sur l’alignement HMM-HMM
hhsuite-data (3.0~beta2+dfsg-3)
sensitive protein sequence searching based on HMM-HMM alignment (data)
hilive (0.3-2)
realtime alignment of Illumina reads
hisat2 (2.0.5-1)
graph-based alignment of short nucleotide reads to many genomes
hmmer (3.1b2+dfsg-5)
Prépare des modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
hmmer2 (2.3.2-13)
Prépare des modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
hmmer2-pvm (2.3.2-13)
Programmes HMMER avec support PVM (machine virtuelle parallèle)
hodie (1.5-2+b1)
Affiche la date en latin
horae (071~svn537-2.1) [contrib]
interactive graphical processing and analysis of EXAFS data
hpcc (1.4.3-1+b5)
mesureur de performance HPC Challenge
htcondor (8.4.11~dfsg.1-1+deb9u1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386], 8.4.11~dfsg.1-1 [mips, mipsel, ppc64el, s390x]) [security]
distributed workload management system
hyphy-common (2.2.7+dfsg-1)
test statistique en utilisant des phylogénies – fichiers communs
hyphy-mpi (2.2.7+dfsg-1+b2)
Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
hyphy-pt (2.2.7+dfsg-1+b2)
Hypothesis testing using Phylogenies (pthreads version)
hyphygui (2.2.7+dfsg-1+b2)
Hypothesis testing using Phylogenies (GTK+ gui)
idba (1.1.3-1)
iterative De Bruijn Graph De Novo short read assembler for transcriptome
ifeffit (2:1.2.11d-10.1) [contrib]
Interactive XAFS analysis program
ifrit (4.1.2-5+b5)
outil puissant pour visualiser des ensembles de données tridimensionnelles
igv (2.3.90+dfsg-1) [non-free]
Integrative Genomics Viewer
imagej (1.51i+dfsg-2)
Image processing program inspired by NIH Image
imagevis3d (3.1.0-5)
application de bureau pour le rendu volumique direct de grands volumes de données
imview (1.1.9c-17+b1)
Application de visualisation et d'analyse d'images
indelible (1.03-2+b1)
powerful and flexible simulator of biological evolution
indigo-utils (1.1.12-2)
Organic Chemistry Toolkit Utilities
infernal (1.1.2-1)
inférence d’alignements structurels secondaires d’ARN
ipig (0.0.r5-2)
integrating PSMs into genome browser visualisations
iqtree (1.5.3+dfsg-2)
efficient phylogenetic software by maximum likelihood
irstlm (6.00.05-2)
boîte à outils de modélisation de langage IRST
ismrmrd-schema (1.3.3-1)
schema for ISMRMRD
ismrmrd-tools (1.3.3-1+b1)
command-line tools for ISMRMRD
itksnap (3.4.0-2+b3)
segmentation semi-automatique de structures pour les images en 3D
iva (1.0.8+ds-1)
assemblage itératif de séquences virales
jaligner (1.0+dfsg-4)
algorithme de Smith-Waterman avec l'amélioration de Gotoh
jblas (1.2.3-6)
bibliothèque rapide d'algèbre linéaire pour Java
jellyfish (2.2.6-1+b1)
count k-mers in DNA sequences
jellyfish-examples (2.2.6-1+b1)
count k-mers in DNA sequences (examples for testing)
jemboss (6.6.0+dfsg-6)
graphical user interface to EMBOSS
jmodeltest (2.1.10+dfsg-5)
sélection par calculs intensifs de modèle de substitution de nucléotide
jmol (14.6.4+2016.11.05+dfsg1-3)
visualisateur moléculaire
jsamp (1.3.5-1)
Java Simple Application Messaging Protocol tool for VO
julia (0.4.7-6+b3)
langage de programmation haute-performance pour le calcul technique
julia-common (0.4.7-6)
langage de programmation haute-performance pour le calcul technique –⋅fichiers communs
jupyter-notebook (4.2.3-4+deb9u2) [security]
notebook interactif de Jupyter
kalign (1:2.03+20110620-3)
Alignement séquentiel multiple global et progressif
kalzium (4:16.08.3-1)
outil de table périodique et de chimie
kalzium-data (4:16.08.3-1)
fichiers de données pour Kalzium
khmer (2.0+dfsg-10)
comptage k-mer, filtrage et parcours de graphe de séquences d’ADN en mémoire vive
khmer-common (2.0+dfsg-10)
common files for the khmer project tools
kineticstools (0.6.1+20161222-1)
detection of DNA modifications
kineticstools-data (0.6.1+20161222-1)
detection of DNA modifications -- data files
king-probe (2.13.110909-2)
Evaluate and visualize protein interatomic packing
kissplice (2.4.0-p1-1)
détection de diverses sortes de polymorphismes dans les données du séquençage de l'ARN
klustakwik (2.0.1-1+b2)
classement automatique des échantillons (pics) dans des regroupements
kmc (2.3+dfsg-5)
décompte de k-mers dans des séquences de génome
kmer (0~20150903+r2013-3)
suite of tools for DNA sequence analysis
konclude (0.6.2~dfsg-3+b1)
tableau-based description logic reasoner for the semantic web
kraken (0.10.5~beta-2+b1)
assigning taxonomic labels to short DNA sequences
kst (2.0.3-5+b4 [mips], 2.0.3-5+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x])
outil scientifique de tracé de données
kst-data (2.0.3-5)
set of data files for kst
kstars (4:16.08.3-2)
planétarium pour KDE
kstars-data (4:16.08.3-2)
fichiers de données pour le planétarium KStars
kstars-data-extra-tycho2 (1.1r1-9.1) [non-free]
Tycho-2 star catalog for KStars
kxterm (20061220+dfsg3-4.3+deb9u2)
Suite d'analyse de données CERNLIB - émulateur de terminal KUIP
lambda-align (1.0.1-2)
Local Aligner for Massive Biological DatA
lammps (0~20161109.git9806da6-7)
Molecular Dynamics Simulator
last-align (830-1)
comparaison de séquences biologiques à l'échelle du génome
lbt (1.2.2-6)
Convertit des formules LTL en automates Büchi
leaff (0~20150903+r2013-3)
biological sequence library utilities and applications
lefse (1.0+20160802-1)
determine features of organisms, clades, taxonomic units, genes
lhapdf-pdfsets-minimal (5.9.1-5)
Minimal PDF Sets of LHAPDF
libadios-bin (1.11.0-1+b1)
ADIOS système flexible d'entrées-sorties — exécutables
libapertium3-3.4-0 (3.4.0~r61013-5+b1)
bibliothèque partagée pour Apertium
libball1.4-data (1.4.3~beta1-3)
bibliothèque d'algorithmes de biochimie –⋅fichiers de données
libcamitk4 (4.0.4-2)
boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – exécutable
libcassie1v5 (1.0.5-1+b1 [amd64], 1.0.5-1 [arm64, armel, armhf, i386, mips, mips64el, mipsel, ppc64el, s390x])
bibliothèque mettant en œuvre des algorithmes de recherche
libcg3-0 (0.9.9~r11624-1+b3)
Runtime for CG-3
libclhep2.1v5 (2.1.4.1+dfsg-1)
CLHEP : bibliothèque de classe pour la physique des hautes énergies
libdivsufsort3 (2.0.1-2)
fast suffix array construction
libdynamicedt3d1.8 (1.8.1+dfsg-1)
Incrementally updatable Euclidean distance transform library
libeccodes-data (2.0.2-5)
GRIB and BUFR enecoding/encoding software library - data
libgeotiff-epsg (1.4.2-1) [non-free]
GeoTIFF library -- EPSG Geodetic Parameter Dataset
libgfsgl0 (20121130+dfsg-4)
graphical viewer for Gerris simulation files. Shared library
libghemical-data (3.0.0-4.1)
Molecular Modelling Library (data files)
libgnuradio-fcdproplus3.7.10 (3.7.25.4b6464b-2+b2)
Funcube Dongle Pro Plus controller for GNU Radio (runtime)
libgrits5 (0.8.1-2)
Grits is a Virtual Globe library
libgtkdatabox-0.9.3-0-glade (1:0.9.3.0+dfsg-3)
Gtk+ library to display large amounts of numerical data (glade API)
libgtkdatabox-0.9.3-0-libglade (1:0.9.3.0+dfsg-3)
Gtk+ library to display large amounts of numerical data (glade lib)
libgyoto6 (1.2.0-2)
Gyoto framework main library an standard plug-in
libhdf5-jni (1.10.0-patch1+docs-3+deb9u1)
native library used by libhdf5-java
libhfst45 (3.10.0~r2798-3)
Helsinki Finite-State Transducer Technology Libraries
libhfstospell5 (0.4.0~r4643-4+b2)
HFST spell checker runtime libraries
libismrmrd1.3 (1.3.3-1+b1)
ISMRM Raw Data format (ISMRMRD)
liblas-bin (1.8.1-3+b1)
ASPRS LiDAR data translation toolset
liblemon-utils (1.3.1+dfsg-1+b2)
Library for Efficient Modeling and Optimization in Networks (utilities)
libliggghts3 (3.5.0+repack1-10)
Open Source DEM Particle Simulation Software. Shared library
liblinear-tools (2.1.0+dfsg-2)
Standalone applications for LIBLINEAR
liblorene-debian1 (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
liblorene shared library
liblorene-export-debian0 (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
liblorene_export shared library
liblorenef77-debian1 (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
liblorenef77 shared library
liblttoolbox3-3.3-0v5 (3.3.3~r68466-2+b1)
Shared library for lttoolbox
libncarg-bin (6.3.0-13)
NCAR command-language library - development tools
libncarg-data (6.3.0-13)
NCAR command-language library - Data
libngram-tools (1.3.0-1)
OpenGRM n-gram Language Modeling toolkit
libocas-tools (0.97+dfsg-3)
Standalone applications implementing the OCAS solver
liboctomap1.8 (1.8.1+dfsg-1)
3D occupancy grid mapping approach library for mapping
liboctovis1.8 (1.8.1+dfsg-1)
Visualization library for OctoMap
libopenfoam (4.1+dfsg1-1)
Set of programs for Computational Fluid Dynamics (CFD). Libraries
libopengm-bin (2.3.6+20160905-1+b2)
command line tools for OpenGM
libotb (5.8.0+dfsg-3)
ORFEO Toolbox library metapackage
libotb-apps (5.8.0+dfsg-3)
Plugins for ORFEO Toolbox applications
libpwiz-tools (3.0.9393-1+b2)
ProteoWizard command line tools
libqgis-customwidgets (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
composants graphiques personnalisés de QGIS pour QT Designer
libqgis-server2.14.11 (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
QGIS –⋅bibliothèque serveur partagée
libqtpropertybrowser4 (4.0.4-2)
Qt Property Browser Library - runtime
librasterlite2-1 (1.0.0~rc0+devel1-4)
library for huge raster coverages using a SpatiaLite DBMS
libsilo-bin (4.10.2-6+b3)
Utilities to manipulate libsilo files
libsimgrid3.14 (3.14.159-2)
Toolkit for scalable simulation of distributed applications
libstxxl1v5 (1.4.1-2+b1)
C++ Standard Template Library for extra large datasets
libvcflib-tools (1.0.0~rc1+dfsg1-3)
C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
libxy-bin (1.3-1.1+b1)
xylib – utilitaires
libyade (2017.01a-8)
plateforme pour la méthode des éléments distincts — bibliothèques
liggghts (3.5.0+repack1-10)
Open Source DEM Particle Simulation Software.
litl-tools (0.1.8-2+b2)
Lightweight Trace Library - tools
logcentral (2.7-1.1+b1)
service de journalisation pour des applications distribuées
logcentral-tools (2.7-1.1+b1)
service de journalisation pour des applications distribuées
logol (1.7.5-1)
Pattern matching tool using Logol language
logol-bin (1.7.5-1)
Pattern matching tool using Logol language
loki (2.4.7.4-6+b1)
analyse de déséquilibre de liaison avec des chaînes de Markov
looptools (2.8-1+b1)
Integral Evaluator of One-loop Feynman Diagram
lorene (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
framework for numerical relativity
lorene-codes-src (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1)
source files of LORENE-based codes
ltrsift (1.0.2-7)
post-traitement et classification de rétrotransposons LTR
ltrsift-examples (1.0.2-7)
example data for LTRsift
lttoolbox-dev (3.3.3~r68466-2+b1)
Development tools and library for lttoolbox
lutefisk (1.0.7+dfsg-4+b1)
interprétation de novo d’un spectre de CID de peptide
macs (2.1.1.20160309-1)
analyse basée sur modèles de ChIP-Seq venant de séquenceurs de lectures courtes
macsyfinder (1.0.2-3)
detection of macromolecular systems in protein datasets
maffilter (1.1.0-1+dfsg-2+b2)
process genome alignment in the Multiple Alignment Format
maffilter-examples (1.1.0-1+dfsg-2)
process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)
mafft (7.307-1)
programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
mapdamage (2.0.6+dfsg-2)
tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences
mapsembler2 (2.2.3+dfsg-3+b1)
bioinformatics targeted assembly software
maq (0.7.1-7)
correspondance de lectures de séquences d'ADN polymorphique de longueur courte à des séquences de référence
maqview (0.2.5-7+b1)
graphical read alignment viewer for short gene sequences
mash (1.1.1-2)
fast genome and metagenome distance estimation using MinHash
massxpert (3.6.1-1)
logiciel de spectrométrie de masse de polymères linéaires
massxpert-data (3.6.1-1)
linear polymer mass spectrometry software - arch-indep data
matlab-gdf (0.1.2-2) [contrib]
IO library for the GDF -- Matlab interface
maude (2.7-2+b1)
cadriciel logique de haute performance
mauve-aligner (2.4.0+4734-3)
multiple genome alignment
mayavi2 (4.5.0-1)
paquet de visualisation scientifique de données 2D ou 3D
mbt (3.2.16-1+b1)
générateur d’étiquetage basé sur la mémoire et étiqueteur
mbtserver (0.11-1+b1)
Server extensions for the MBT tagger
meep (1.3-4+b1)
Paquet logiciel pour la simulation FDTD
meep-lam4 (1.3-2+b1)
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
meep-mpi-default (1.3-3+b4 [s390x], 1.3-3+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips, mips64el, mipsel, ppc64el])
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
meep-mpich2 (1.3-4+b1)
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
meep-openmpi (1.3-3+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips, mips64el, mipsel, ppc64el], 1.3-3+b2 [s390x])
software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
melting (4.3.1+dfsg-2+b1)
calcule la température de fusion de duplex d'acide nucléique
melting-gui (4.3.1+dfsg-2)
interface graphique pour calculer la température de fusion de duplex d'acide nucléique
merkaartor (0.18.3+ds-1+b1)
éditeur de carte pour OpenStreetMap.org
meryl (0~20150903+r2013-3)
in- and out-of-core kmer counting and utilities
metaphlan2 (2.6.0+ds-2)
Metagenomic Phylogenetic Analysis
metaphlan2-data (2.6.0+ds-2)
data package for Metagenomic Phylogenetic Analysis
metastudent (2.0.1-4)
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence
metastudent-data (2.0.1-2)
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data files
metastudent-data-2 (1.0.0-2)
predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data #2
metview (4.8.0-4)
visualisation des données et environnement d’analyse interactifs
metview-data (4.8.0-4)
Data needed for the Metview data analysis environment
mgltools-bhtree (1.5.7-1) [non-free]
Bhtree library extension module
mgltools-cadd (1.5.7-1) [non-free]
Computer Aided Drug Discovery (CADD) Pipeline
mgltools-cmolkit (1.5.7~rc1+cvs.20140424-1) [non-free]
Python classes to interpret trajectories of Gromacs
mgltools-dejavu (1.5.7-1) [non-free]
visualization of 3D geometry using the OpenGL with Python
mgltools-geomutils (1.5.7-1) [non-free]
Python library for geometric analyses
mgltools-mglutil (1.5.7-2) [non-free]
Molecular Graphics Laboratory utility collection
mgltools-molkit (1.5.7~rc1+cvs.20140424-1) [non-free]
Python classes to read and manipulate molecules
mgltools-networkeditor (1.5.7-1) [non-free]
Python GUI library for the editing of networks
mgltools-opengltk (1.5.7-1) [non-free]
Opengltk Python extension
mgltools-pyautodock (1.5.7-1) [non-free]
Python implementation of autodock
mgltools-pybabel (1.5.7-1) [non-free]
molecular structure file access and interpretation
mgltools-pyglf (1.5.7-1) [non-free]
GLF library Python extension to write text in OpenGL
mgltools-scenario2 (1.5.7-1) [non-free]
Python-based viewer of molecular structures
mgltools-sff (1.5.6~rc3~cvs.20120206-1) [non-free]
Simple Force Field for Python
mgltools-support (1.5.7-1) [non-free]
Update mechanism of MGLTools
mgltools-symserv (1.5.7-1) [non-free]
Symetry server
mgltools-utpackages (1.5.7-1) [non-free]
UT Austin software Python extensions
mgltools-viewerframework (1.5.7-1) [non-free]
ViewerFramework supports building visualization applications
mgltools-vision (1.5.7-1) [non-free]
Python-based Visual Programming Environment
mgltools-visionlibraries (1.5.7-1) [non-free]
Extensions for Python-based Visual Programming Environment
mgltools-volume (1.5.7-1) [non-free]
Volume rendering Python package
mgltools-webservices (1.5.7-1) [non-free]
webservices for components of autodocktools
mhap (2.1.1+dfsg-1)
locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
mia-doctools (2.4.3-5)
Helper scripts for run-time document creation
mia-tools (2.4.3-5)
Command line tools for gray scale image processing
mia-viewit (1.0.4-1+b1)
programme de visualisation pour des ensembles de données en 3D créés avec MIA
mialmpick (0.2.13-1)
outils pour le choix de points de repère dans des ensembles de données de volumes en 3D
microbegps (1.0.0-2)
explorative taxonomic profiling tool for metagenomic data
microbiomeutil (20101212+dfsg1-1)
utilitaires d'analyse de microbiome
microbiomeutil-data (20101212+dfsg1-1)
Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
microhope (4.2.1+dfsg-1)
cadriciel matériel et logiciel pour apprendre les microcontrôleurs
minc-tools (2.3.00+dfsg-1.1+b1)
Outils pour le format MNI d'imagerie médicale
minia (1.6906-1+b2)
short-read biological sequence assembler
miniasm (0.2+dfsg-2+b1)
assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées
minimap (0.2-3+b1)
correspondances approximatives de longues séquences biologiques telles que les lectures d’ADN
minisat (1:2.2.1-5+b3)
solveur SAT rapide et léger
minisat+ (1.0-3)
solveur de contraintes pseudo booléennes
minisat2 (1:2.2.1-5+b3)
paquet de transition pour minisat
minisat2
paquet virtuel fourni par minisat
mipe (1.1-5)
Outil de sauvegarde de données dérivées de PCR
mira-assembler (4.9.6-2)
assembleur de séquences génomiques exprimées utilisant la méthode globale
mira-rfam-12s-rrna (4.9.6-2)
extract of RFAM 12 rRNA database
missfits (2.8.0-1+b1)
Basic maintenance and packaging tasks on FITS files
mlpack-bin (2.1.1-1)
intuitive, fast, scalable C++ machine learning library (binaries)
mlv-smile (1.47-4+b1)
Find statistically significant patterns in sequences
mmass (5.5.0-5)
outil de spectrométrie de masse pour les protéomes
mmass-modules (5.5.0-5)
Mass spectrometry tool for proteomics - extension modules
mobyle (1.5.5+dfsg-2)
portail web fournissant des formulaires web pour des logiciels en ligne de commande
mobyle-programs (5.1.2-1)
Program descriptions for the mobyle portal
mobyle-tutorials (1.5.0-2)
program tutorials for the mobyle portal
mobyle-utils (1.5.5+dfsg-2)
outils binaires utilisés par Mobyle
mocassin (2.02.72-2)
MOnte CArlo SimulationS of Ionised Nebulae
mocassin-benchmarks (2.02.72-2)
benchmarks for the photoionisation code MOCASSIN
mocassin-data (2.02.72-2)
atomic and optical data for the photoionisation code MOCASSIN
mocassin-examples (2.02.72-2)
Examples for the photoionisation code MOCASSIN
molds (0.3.1-1+b5 [amd64, arm64, armhf, i386], 0.3.1-1+b4 [ppc64el], 0.3.1-1 [mips64el])
Semi-empirical electronic structure and molecular dynamics
mona (1.4-17-1+b1)
démonstration automatique de théorèmes
montage (4.0+dfsg-3+b3)
Toolkit for assembling FITS images into mosaics
montage-gridtools (4.0+dfsg-3+b3)
Create files to run montage on the grid
montecarlo-base (20061220+dfsg3-3.1)
[Physics] Common files for CERNLIB Monte Carlo libraries
montecarlo-data (20061220+dfsg3-3.1)
[Physics] data for CERNLIB Monte Carlo libraries
mopac7-bin (1.15-6+b1)
bibliothèque de chimie quantique semi-empirique – fichiers binaires
morse-simulator (1.4-2)
Multi-OpenRobot Simulation Engine
morse-simulator-data (1.4-2)
Multi-OpenRobot Simulation Engine
mothur (1.38.1.1-1)
ensemble pour analyse de séquences pour la recherche sur le microbiome
mothur-mpi (1.38.1.1-1)
mpi-enabled binary for mothur
mpb (1.5-2+b7 [s390x], 1.5-2+b5 [amd64, armel, armhf, i386, mips, mipsel], 1.5-2+b4 [arm64, ppc64el], 1.5-2+b3 [mips64el])
Photonic-Bands du MIT
mpb-mpi (1.5-2+b7 [s390x], 1.5-2+b5 [amd64, armel, armhf, i386, mips, mipsel], 1.5-2+b4 [arm64, ppc64el], 1.5-2+b3 [mips64el])
programme Photonic-Bands du MIT, version parallèle (mpich)
mpb-scm (1.5-2)
MIT Photonic-Bands initialisation files
mpqc (2.3.1-18+deb9u1)
Massively Parallel Quantum Chemistry Program
mpqc-openmpi (2.3.1-18+deb9u1)
Massively Parallel Quantum Chemistry Program (OpenMPI transitional package)
mpqc-support (2.3.1-18+deb9u1)
Massively Parallel Quantum Chemistry – outils d’assistance
mpqc3 (0.0~git20170114-4)
Massively Parallel Quantum Chemistry Program
mpqc3-data (0.0~git20170114-4)
Massively Parallel Quantum Chemistry Program (data files)
mrbayes (3.2.6+dfsg-1+b4)
Bayesian Inference of Phylogeny
mrbayes-mpi (3.2.6+dfsg-1+b4)
inférence bayésienne de phylogenèse – version MPI
mriconvert (1:2.1.0-1)
utilitaire de conversion de fichier d’image médicale
mricron (0.20140804.1~dfsg.1-2+b1)
conversion, visualisation et analyse d’images de résonance magnétique
mricron-data (0.20140804.1~dfsg.1-2)
data files for MRIcron
mrpt-apps (1:1.4.0-7+b1 [mips, mips64el, mipsel], 1:1.4.0-7 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el, s390x])
boîte à outils pour la programmation robotique - applications graphiques et console
mrpt-common (1:1.4.0-7)
boîte à outils pour la programmation robotique – exemples de fichier et d’ensembles de données
mrs (6.0.5+dfsg-2+b2)
système de recherche d'information pour les banques de données
mssstest (3.0-5) [non-free]
Normalisation of disease scores for patients with Multiple Sclerosis
mummer (3.23+dfsg-2)
Alignement de séquence efficace de génomes complets
munipack (0.5.7-2)
Astronomical photometry software package
munipack-cli (0.5.7-2)
Command line interface of Munipack
munipack-core (0.5.7-2)
Core routines of Munipack
munipack-gui (0.5.7-2)
interface graphique pour Munipack
murasaki (1.68.6-6+b4)
homology detection tool across multiple large genomes
murasaki-common (1.68.6-6)
homology detection tool across multiple large genomes (common files)
murasaki-mpi (1.68.6-6+b4)
homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
muscle (1:3.8.31+dfsg-2)
Programme d'alignements multiples de séquences de protéine
music-bin (1.0.7-1.3)
Multi-Simulation Coordinator for MPI -- Utilities
mustang (3.2.3-1)
alignement structurel multiple de protéines
mustang-testdata (3.2.3-1)
multiple structural alignment of proteins, test data
nanopolish (0.5.0-1+b1)
consensus caller for nanopore sequencing data
nast-ier (20101212+dfsg1-1+b1)
NAST-based DNA alignment tool
nastran (0.1.95-1) [non-free]
NASA Structural Analysis System
ncbi-blast+ (2.6.0-1)
suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
ncbi-blast+-legacy (2.6.0-1)
script d’appel de legacy de BLAST du NCBI
ncbi-entrez-direct (6.10.20170123+ds-1)
NCBI Entrez utilities on the command line
ncbi-epcr (2.3.12-1-4)
Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites
ncbi-rrna-data (6.1.20170106+dfsg1-0+deb9u1)
grandes bases de données BLAST d'ARN ribosomique distribuées avec le kit de développement du NCBI
ncbi-seg (0.0.20000620-3+b1)
tool to mask segments of low compositional complexity in amino acid sequences
ncbi-tools-bin (6.1.20170106+dfsg1-0+deb9u1)
bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires en mode texte
ncbi-tools-x11 (6.1.20170106+dfsg1-0+deb9u1)
bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires⋅X
ncl-ncarg (6.3.0-13)
NCAR Command Language and NCAR graphics
ncl-tools (2.1.18+dfsg-2+b1)
tools to deal with NEXUS files
nco (4.6.3-1+b1)
opérateurs en ligne de commandes pour analyser des fichiers netCDF
ncoils (2002-4+b1)
prédiction de structure secondaire de superhélice
ncview (2.1.7+ds-1+b2)
navigateur graphique X11 pour les fichiers au format NetCDF
neat (2.0-2)
Nebular Empirical Analysis Tool
neobio (0.0.20030929-2)
calcul d'alignements de séquences d'acides aminés et de nucléotides
netcdf-bin (1:4.4.1.1-2)
Programmes pour lire et écrire des fichiers NetCDF
neurodebian (0.37.6)
neuroscience-oriented distribution - repository configuration
neurodebian-archive-keyring (0.37.6)
distribution orientée neurosciences – clés GnuPG d’archive
neurodebian-desktop (0.37.6)
neuroscience-oriented distribution - desktop integration
neurodebian-dev (0.37.6)
neuroscience-oriented distribution - development tools
neurodebian-popularity-contest (0.37.6)
neuroscience-oriented distribution - popcon integration
nifti2dicom (0.4.11-1+b3)
convert 3D medical images to DICOM 2D series
nifti2dicom-data (0.4.11-1)
data files for nifti2dicom
njplot (2.4-7)
programme de dessin d’arbre phylogénétique
norsnet (1.0.17-2)
tool to identify unstructured loops in proteins
norsp (1.0.6-2)
predictor of non-regular secondary structure
numdiff (5.8.1-2+b1)
comparaison de fichiers similaires avec des champs numériques
nutsqlite (1.9.9.3-2)
Dietary nutrition analysis software
oar-common (2.5.7-3)
OAR batch scheduler common package
oar-node (2.5.7-3)
OAR batch scheduler node package
oar-server (2.5.7-3)
OAR batch scheduler server package
oar-server-mysql (2.5.7-3)
OAR batch scheduler MySQL server backend package
oar-server-pgsql (2.5.7-3)
OAR batch scheduler PostgreSQL server backend package
oar-user (2.5.7-3)
OAR batch scheduler user package
oar-user-mysql (2.5.7-3)
OAR batch scheduler MySQL user backend package
oar-user-pgsql (2.5.7-3)
OAR batch scheduler PostgreSQL user backend package
oar-web-status (2.5.7-3)
OAR batch scheduler visualization tool package
obdgpslogger (0.16-1.3+b1)
ensemble d’outils pour la journalisation de données OBD-II de GPS
oce-draw (0.17.2-2)
OpenCASCADE Community Edition CAE platform shared library
octave-bart (0.4.00-1)
liaisons Octave pour BART
octave-biosig (1.3.0-2.2)
liaisons Octave à la bibliothèque BioSig
octave-gdf (0.1.2-2+b8 [mips], 0.1.2-2+b7 [amd64, armel, armhf, i386, mipsel, s390x], 0.1.2-2+b5 [ppc64el], 0.1.2-2+b4 [arm64], 0.1.2-2+b2 [mips64el])
bibliothèque IO pour GDF – interface pour Octave
octave-lhapdf (5.9.1-5)
Octave Bindings for LHAPDF
octave-psychtoolbox-3 (3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1)
toolbox for vision research -- Octave bindings
octomap-tools (1.8.1+dfsg-1)
Tools for 3D occupancy grid mapping
octovis (1.8.1+dfsg-1)
outil de visualisation pour OctoMap
odil (0.7.3-1)
C++11 library for the DICOM standard (application)
ogdi-bin (3.2.0+ds-2)
bibliothèque OGDI ( interface de magasins de données géographiques libre) – utilitaires
openbabel (2.3.2+dfsg-3)
boîte à outils de chimie – interface en ligne de commande
openbabel-gui (2.3.2+dfsg-3)
boite à outils logicielle dans le domaine de la chimie − interface graphique
opencaster (3.2.2+dfsg-1.1+b1)
MPEG2 transport stream data generator and packet manipulator
openfoam (4.1+dfsg1-1)
Set of programs for Computational Fluid Dynamics (CFD). Binaries
openfoam-examples (4.1+dfsg1-1)
Set of programs for Computational Fluid Dynamics (CFD). Examples
openmolar (1.0.15-gd81f9e5-1)
logiciel de gestion de cabinet dentaire
openmx (3.7.6-1+b6)
paquet de simulations nanométriques
openmx-data (3.7.6-1)
package for nano-scale material simulations (data)
openrocket (15.03)
Simulateur de microfusée
opensesame (0.27.4-2.1)
graphical experiment builder for the social sciences
openturns-examples (1.7-3)
examples of OpenTURNS functionalities
openturns-validation (1.7-3)
validation files for OpenTURNS
openuniverse (1.0beta3.1+dfsg-6)
simulateur d'univers 3D
openuniverse-common (1.0beta3.1+dfsg-6)
fichiers de données du simulateur en 3D de l’univers
optgeo (2.23-1+b1)
simulateur d'optique géométrique
opticalraytracer (3.2-1.1)
Virtual lens design workshop
origami (1.2.7+really0.7.4-1.1)
command-line management tool for Folding @ Home clients
orthanc (1.2.0+dfsg-1)
Lightweight, RESTful DICOM server for medical imaging
orthanc-dicomweb (0.3+dfsg-1+b2)
Plugin to extend Orthanc with support of WADO and DICOMweb
orthanc-imagej (1.1+dfsg-1)
ImageJ plugin to import images from Orthanc
orthanc-postgresql (2.0-3+b1)
Plugins to use PostgreSQL as a database back-end to Orthanc
orthanc-webviewer (2.2-1+b2)
Web viewer of medical images for Orthanc
ossim-core (1.8.20.3+ds-5+b1)
utilitaires centraux d’OSSIM
otb-bin (5.8.0+dfsg-3)
applications en ligne de commande d’ORFEO Toolbox
otb-bin-qt (5.8.0+dfsg-3)
interface graphique pour les applications d’ORFEO Toolbox
otb-testdriver (5.8.0+dfsg-3)
bibliothèque d’ORFEO Toolbox – OTBTestDriver
otf-trace (1.12.5+dfsg-2+b2)
Open Trace Format support library - development files
ovito (2.8.1+dfsg2-5)
visualization and analysis tool for atomistic simulation data
p4vasp (0.3.29+dfsg-3)
visualization suite for the Vienna Ab-initio Simulation Package (VASP)
paje.app (1.98-1+b4)
outil générique de visualisation (diagramme de GANTT et autres)
paml (4.8+dfsg-1) [non-free]
Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)
paraclu (9-1+b2)
Parametric clustering of genomic and transcriptomic features
parafly (0.0.2013.01.21-3+b1)
parallel command processing using OpenMP
paraview (5.1.2+dfsg1-2)
application parallèle de visualisation
parsinsert (1.04-2)
Parsimonious Insertion of unclassified sequences into phylogenetic trees
parsnp (1.2+dfsg-3)
rapid core genome multi-alignment
paw (1:2.14.04.dfsg.2-9.1+b3)
Physics Analysis Workstation (Station d'analyse pour la physique) - programme d'analyse graphique
paw++ (1:2.14.04.dfsg.2-9.1+b3)
Outils d'analyse physique (version améliorée avec Lesstif)
paw-common (1:2.14.04.dfsg.2-9.1)
Physics Analysis Workstation (common files)
paw-demos (1:2.14.04.dfsg.2-9.1)
Exemples et tests pour PAW
pbbamtools (0.7.4+ds-1)
processing Pacific Biosciences binary alignment/map files
pbbarcode (0.8.0-4)
annotate PacBio sequencing reads with barcode information
pbdagcon (0.3+20161121+ds-1)
sequence consensus using directed acyclic graphs
pbgenomicconsensus (2.1.0-1)
Pacific Biosciences variant and consensus caller
pbh5tools (0.8.0+dfsg-5)
tools for manipulating Pacific Biosciences HDF5 files
pbhoney (15.8.24+dfsg-2)
genomic structural variation discovery
pbjelly (15.8.24+dfsg-2)
genome assembly upgrading tool
pbsim (1.0.3-2)
simulateur pour les lectures de séquences de PacBio
pdb2pqr (2.1.1+dfsg-2)
Preparation of protein structures for electrostatics calculations
pegasus-wms (4.4.0+dfsg-6)
Scientific workflow management system for HTCondor
perlprimer (1.2.3-1)
Conception graphique d'amorce de PCR
perm (0.4.0-2)
efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
phipack (0.0.20160614-2)
PHI test and other tests of recombination
phybin (0.3-1+b1)
binning/clustering newick trees by topology
phylip (1:3.696+dfsg-5)
paquet de programmes pour déduire les phylogénies
phyml (3:3.2.0+dfsg-7+b1)
estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
physamp (0.2.0-1+b1)
sample sequence alignment according to its corresponding phylogenetic tree
phyutility (2.7.3-1)
simple analyses or modifications on both phylogenetic trees and data matrices
picard-tools (2.8.1+dfsg-1)
outils en ligne de commande pour manipuler les fichiers SAM et BAM
picosat (960-1+b2)
solveur SAT avec gestion de démonstrations et « core »
piler (0~20140707-1+b1)
genomic repeat analysis
pirs (2.0.2+dfsg-5.1+b1)
Profile based Illumina pair-end Reads Simulator
pirs-examples (2.0.2+dfsg-5.1)
profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (example data)
pirs-profiles (2.0.2+dfsg-5.1)
profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (profile data)
pktools (2.6.7-3)
utilitaires complémentaires pour GDAL pour un traitement efficace d'images matricielles
placnet (1.03-2)
Plasmid Constellation Network project
planets (0.1.13-16)
simulation gravitationnelle de corps planétaires
plast (2.3.1+dfsg-4)
Parallel Local Sequence Alignment Search Tool
plast-example (2.3.1+dfsg-4)
Parallel Local Sequence Alignment Search Tool (example data)
plastimatch (1.6.5+dfsg.1-1)
reconstruction d’images médicales et recalage
plink (1.07-7)
outils d'analyse d'associations sur le génome entier
plink1.9 (1.90~b3.45-170113-1)
outils d'analyse d'associations sur le génome entier
pnetcdf-bin (1.7.0-1+b2)
Programs for reading and writing parallel NetCDF files
poa (2.0+20060928-4+b1)
alignement d'ordre partiel pour les alignements multiples de séquences
populations (1.2.33+svn0120106-2.1+b1)
logiciel de génétique de populations
poretools (0.6.0+dfsg-2)
toolkit for nanopore nucleotide sequencing data
poretools-data (0.6.0+dfsg-2)
toolkit for nanopore nucleotide sequencing data -- sample datasets
pp-popularity-contest (1.0.6-2+b4 [amd64, armel, armhf, i386, mips, mipsel, s390x], 1.0.6-2+b3 [arm64, ppc64el], 1.0.6-2+b2 [mips64el])
PredictProtein popularity contest
pprepair (0.0~20160321-87ffae5-1+b3)
outil de réparation de partition planaire
praat (6.0.23-1)
programme pour l'analyse et la synthèse de la parole
prank (0.0.150803-2)
Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
predictnls (1.0.20-3)
prédiction et analyse de signaux de localisation nucléaire de protéines
prepair (0.7-6+b4)
outil de réparation de polygone
prepair-data (0.7-6)
outil de réparation de polygone – données d’exemples
prime-phylo (1.0.11-4+b3)
bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
primer3 (2.3.7-3)
outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN
primer3-examples (2.3.7-3)
tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification (examples)
proalign (0.603-2)
logiciel d'alignements de multiples séquences probabilistes
probabel (0.4.5-3+b1)
Toolset for Genome-Wide Association Analysis
probabel-examples (0.4.5-3)
Example files for ProbABEL
probalign (1.4-5)
multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities
probcons (1.12-11)
alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
probcons-extra (1.12-11)
Programmes optionnels pour le paquets probcons
proda (1.0-10)
Alignement multiple de séquences protéiques
prodigal (1:2.6.3-1+b1)
Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
profbval (1.0.22-4)
prédicteur des résidus de protéine flexibles/rigides à partir d'une séquence
profisis (1.0.11-3)
prédiction des sites d'interaction protéine-protéine à partir d'une séquence
profnet-bval (1.0.22-4)
neural network architecture for profbval
profnet-chop (1.0.22-4)
neural network architecture for profchop
profnet-con (1.0.22-4)
neural network architecture for profcon
profnet-isis (1.0.22-4)
neural network architecture for profisis
profnet-md (1.0.22-4)
neural network architecture for metadisorder
profnet-norsnet (1.0.22-4)
neural network architecture for norsnet
profnet-prof (1.0.22-4)
neural network architecture for profacc
profnet-snapfun (1.0.22-4)
neural network architecture for snapfun
profphd-net (1.0.22-4)
neural network architecture for profphd
profphd-utils (1.0.10-3+b1)
profphd helper utilities convert_seq and filter_hssp
proftmb (1.1.12-6+b1)
per-residue prediction of bacterial transmembrane beta barrels
progressivemauve (1.2.0+4713-2+b2)
multiple genome alignment algorithms
proj-bin (4.9.3-1)
Cartographic projection library (tools)
proj-rdnap (2008-6) [non-free]
RDNAP grid correction files for PROJ.4
prooftree (0.13-1)
visualisation d’arbre de preuve pour Proof General
proteinortho (5.15+dfsg-1)
Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
prottest (3.4.2+dfsg-2)
selection of best-fit models of protein evolution
psfex (3.17.1+dfsg-3+b2)
Point Spread Function model extractor
psi3 (3.4.0-6+b2 [mips64el], 3.4.0-6+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips, mipsel, ppc64el, s390x])
suite de programme de chimie quantique
psi4 (1:1.0-1+b1)
Quantum Chemical Program Suite
psi4-data (1:1.0-1)
Quantum Chemical Program Suite (data files)
psychopy (1.83.04.dfsg-2)
environnement pour créer des stimuli psychologiques en Python
psychtoolbox-3-common (3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1)
toolbox for vision research -- arch/interpreter independent part
psychtoolbox-3-lib (3.0.14.20170103+git6-g605ff5c.dfsg1-1)
toolbox for vision research -- arch-specific parts
purify (2.0.0-1+b1 [amd64], 2.0.0-1 [armel, armhf, i386])
Collection of routines for radio interferometric imaging
pyfai (0.13.0+dfsg-1)
Fast Azimuthal Integration scripts
pyfr (1.5.0-1)
flux reconstruction in Python
pymca (5.1.3+dfsg-1)
applications et boite à outils pour l’analyse de fluorescence de rayons X – scripts
pymca-data (5.1.3+dfsg-1)
fichiers de données indépendantes de l'architecture pour PyMca
pymoctool (0.4.2-1)
Python Multi-Order Coverage maps tool for Virtual Observatory
pymol (1.8.4.0+dfsg-1)
système de graphismes moléculaires
pymol-data (1.8.4.0+dfsg-1)
data files for PyMOL
pysatellites (2.4-2)
simulation de lancement de satellites
python-drizzle-testdata (1.3-2)
Dithered image combination for Python (Test data)
python-escript (5.0-3)
Escript/Finley finite elements Python2 system (with OpenMP)
python-escript-doc (5.0-3)
Documentation for Escript/Finley
python-escript-mpi (5.0-3)
Escript/Finley finite elements Python2 system (OpenMP + MPI)
python-expyriment (0.7.0+git34-g55a4e7e-3.2)
Python library for cognitive and neuroscientific experiments
python-pybigwig (0.3.2-1)
Python 2 module for quick access to bigBed and bigWig files
python-pynlpl (1.1.2-1)
PyNLPl is a library for Natural Language Processing (Python 2 version)
python3-escript (5.0-3)
Escript/Finley finite elements Python3 system (with OpenMP)
python3-escript-mpi (5.0-3)
Escript/Finley finite elements Python3 system (OpenMP + MPI)
python3-pybigwig (0.3.2-1)
Python 3 module for quick access to bigBed and bigWig files
python3-pynlpl (1.1.2-1)
PyNLPl is a library for Natural Language Processing (Python 3 version)
pyzo (4.3.1-1+deb9u1)
interactive editor for scientific Python
qfits-tools (6.2.0-8+b2)
outils pour manipuler des fichiers FITS
qfitsview (3.3+p1+dfsg-2)
visualisateur de fichier FITS basé sur DPUSER
qgis (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
système d'information géographique –⋅SIG
qgis-api-doc (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
documentation de l'API de QGIS
qgis-common (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture
qgis-plugin-grass (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
greffon GRASS pour QGIS
qgis-plugin-grass-common (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
greffon GRASS pour QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture
qgis-provider-grass (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
fournisseur GRASS pour QGIS
qgis-providers (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
fournisseurs de collections de données pour QGIS
qgis-providers-common (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
fournisseur de collections de données pour QGIS –⋅fichiers indépendants de l'architecture
qgis-server (2.14.11+dfsg-3+deb9u1)
serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC
qmapshack (1.7.2-1)
cartographie GPS (GeoTiff et vectorielle) et gestion d’appareils GPS
qmc (0.94-3.1)
Outil de simplification Quine McClusky
qnifti2dicom (0.4.11-1+b3)
conversion d’images médicales 3D en séries 2D DICOM – interface graphique
qrisk2 (0.1.20150729-2)
calculateur de risque de maladies cardiovasculaires
qthid-fcd-controller (4.1-3+b1)
contrôleur pour le dongle de Funcube
qtltools (1.1+dfsg-1)
Tool set for molecular QTL discovery and analysis
quantum-espresso (6.0-3)
suite Electronic-Structure et Ab-Initio Molecular Dynamics
quantum-espresso-data (6.0-3)
Electronic-Structure and Ab-Initio Molecular Dynamics Suite (Documentation)
qutemol (0.4.1~cvs20081111-6+b2)
visualisation interactive de macromolécules
rambo-k (1.21+dfsg-1)
Read Assignment Method Based On K-mers
rapmap (0.4.0+dfsg-2)
rapid sensitive and accurate DNA read mapping via quasi-mapping
rasmol (2.7.5.2-2)
Visualisation de macromolécules biologiques
raster3d (3.0-3-2+b1)
outils pour la génération d'images de protéines ou d'autres molécules
rate4site (3.0.0-4+b1)
detector of conserved amino-acid sites
rawtran (0.3.8-2+b1)
RAW photo to FITS converter
raxml (8.2.9+dfsg-1+b1)
ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
ray (2.3.1-4+b1)
de novo genome assemblies of next-gen sequencing data
ray-extra (2.3.1-4)
Scripts and XSL sheets for post-processing for ray
rdkit-data (201603.5-2)
Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)
rdp-classifier (2.10.2-1)
extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s
readseq (1-11+b1)
conversion entre formats de séquences
reapr (1.0.18+dfsg-3)
outil universel pour l’évaluation d’assemblage de génomes
relion-bin (1.4+dfsg-2+b2)
toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
relion-bin+gui (1.4+dfsg-2+b2)
parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
relion-bin+mpi (1.4+dfsg-2+b2)
parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
relion-bin+mpi+gui (1.4+dfsg-2+b2)
parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
repeatmasker-recon (1.08-3+b1)
finds repeat families from biological sequences
reprof (1.0.1-4)
prédicteur de structure secondaire de protéines et d'accessibilité
rna-star (2.5.2b+dfsg-1)
aligneur universel et ultra-rapide de RNA-seq
rnahybrid (2.1.2-1+b1)
prédiction rapide et efficace des complexes microARN/cible
roary (3.8.0+dfsg-1)
pipeline de pangénome autonome et très rapide
rsem (1.2.31+dfsg-1)
RNA-Seq by Expectation-Maximization
rtax (0.984-5)
Classification of sequence reads of 16S ribosomal RNA gene
ruby-rgfa (1.3.1-1)
parse, edit and write GFA format graphs in Ruby
saga (2.3.1+dfsg-3)
système d’analyses automatisées géoscientifiques
saga-common (2.3.1+dfsg-3)
SAGA GIS architecture independent files
saint (2.5.0+dfsg-2+b1)
Significance Analysis of INTeractome
salmon (0.7.2+ds1-2+b1)
wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
samtools (1.3.1-3)
processeur d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM
samtools-test (1.3.1-3)
test files for the samtools package
saods9 (7.5+repack1-2)
outil d’affichage d’image pour l’astronomie
saods9-tclpackages (7.5+repack1-2)
Tcl/Tk packages provided with DS9
sat4j (2.3.5-0.2)
bibliothèque de solveurs SAT en Java
savi (1.5.0a-1)
représentation de constellations satellitaires
sbmltoolbox (4.1.0-3)
libsbml toolbox for octave and matlab
scamp (2.0.4-3+b1)
Compute astrometric and photometric solutions
science-astronomy (1.7)
Debian Science pour l'astronomie —⋅paquet de transition
science-astronomy-dev (1.7)
Debian Science pour l'astronomie —⋅paquet de développement de transition
science-biology (1.7)
paquets Debian Science concernant la biologie
science-chemistry (1.7)
paquets pour la chimie de Debian Science
science-config (1.7)
paquet de configuration pour le projet Debian Science
science-dataacquisition (1.7)
paquets d’acquisition de données de Debian Science
science-dataacquisition-dev (1.7)
Debian Science data acquisition development packages
science-distributedcomputing (1.7)
paquets pour le calcul distribué de Debian Science
science-economics (1.7)
Debian Science Economics packages
science-electronics (1.7)
Debian Science Electronics packages
science-electrophysiology (1.7)
paquets de Debian Science pour l'électrophysiologie
science-engineering (1.7)
paquets pour l’ingénierie de Debian Science
science-engineering-dev (1.7)
Debian Science Engineering-dev packages
science-financial (1.7)
Debian Science financial engineering and computational finance
science-geography (1.7)
paquets pour la géographie de Debian Science
science-geometry (1.7)
paquets de géométrie de Debian Science
science-highenergy-physics (1.7)
Debian Science High Energy Physics packages
science-highenergy-physics-dev (1.7)
Debian Science High Energy Physics development packages
science-imageanalysis (1.7)
paquets d’analyse d’image de Debian Science
science-linguistics (1.7)
paquets pour la linguistique de Debian Science
science-logic (1.7)
Debian Science Logic packages
science-machine-learning (1.7)
paquets pour l’apprentissage automatique de Debian Science
science-mathematics (1.7)
Paquets Debian pour les Sciences Mathématiques
science-mathematics-dev (1.7)
Debian Science Mathematics-dev packages
science-meteorology (1.7)
paquets pour la météorologie de Debian Science
science-meteorology-dev (1.7)
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science-nanoscale-physics (1.7)
paquets Debian pour les nanosciences
science-nanoscale-physics-dev (1.7)
paquets de développement Debian pour les nanosciences
science-neuroscience-cognitive (1.7)
paquets pour les neurosciences cognitives de Debian Science
science-neuroscience-modeling (1.7)
paquets de Debian Science pour la modélisation de systèmes neuronaux
science-numericalcomputation (1.7)
paquets pour le calcul numérique de Debian Science
science-physics (1.7)
paquet de physique pour Debian Science
science-physics-dev (1.7)
Debian Science Physics-dev packages
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Debian Science generic tools for presentations
science-psychophysics (1.7)
paquets pour la psychophysique de Debian Science
science-robotics (1.7)
paquets de robotique de Debian
science-robotics-dev (1.7)
Debian Robotics development packages
science-simulations (1.7)
Debian Science Simulation packages
science-social (1.7)
Debian Science social sciences packages
science-statistics (1.7)
paquets pour les statistiques de Debian Science
science-tasks (1.7)
tâches de Debian Science pour tasksel
science-typesetting (1.7)
paquets pour la composition typographique de Debian Science
science-viewing (1.7)
paquets pour la visualisation des données de Debian Science
science-viewing-dev (1.7)
Debian Science development of visualisation applications
scram (0.11.5-1)
Probabilistic Risk Analysis Tool
scrm (1.7.2-1+b1)
simulator of evolution of genetic sequences
sctk (2.4.10-20151007-1312Z+dfsg2-3)
speech recognition scoring toolkit
scythe (0.994-4)
Bayesian adaptor trimmer for sequencing reads
sdrangelove (0.0.1.20150707-2+b2)
radio logicielle d'Osmocom
seaview (1:4.6.1.2-2)
Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
seer (1.1.2-3)
genomic sequence element (kmer) enrichment analysis
seq-gen (1.3.3-1+b1 [armhf], 1.3.3-1 [amd64, armel, i386, mips, mipsel, s390x]) [non-free]
simulate the evolution of nucleotide or amino acid sequences
seqan-apps (2.3.1+dfsg-4)
C++ library for the analysis of biological sequences
seqprep (1.3.2-1)
stripping adaptors and/or merging paired reads of DNA sequences with overlap
seqprep-data (1.3.2-1)
example data set for seqprep - only used for testing
seqtk (1.2-1)
Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format
sextractor (2.19.5+dfsg-4+b1)
extracteur de sources dans des images astronomiques
sga (0.10.15-2)
de novo genome assembler that uses string graphs
shelxle (1.0.816-1)
interface graphique pour SHELXL
sibsim4 (0.20-2+b1)
Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN
sickle (1.33-1+b1)
windowed adaptive trimming tool for FASTQ files using quality
sift (4.0.3b-4) [non-free]
predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect
sigma-align (1.1.3-4+b1)
alignement de multiples séquences d'ADN non codant
sigviewer (0.5.1+svn556-5)
visionneur graphique pour biosignaux tels que EEG, EMG et ECG
sim4 (0.0.20121010-4)
Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique
sim4db (0~20150903+r2013-3)
batch spliced alignment of cDNA sequences to a target genome
simgrid-java (3.14.159-2)
Java bindings for the SimGrid Toolkit
siril (0.9.5-2)
outil de traitement d'images astronomiques
skycat (3.1.2+starlink1~b+dfsg-2+b3)
Image visualization and access to catalogs and data for astronomy
slang-xfig (0.2.0~.35-2)
produce plots and drawings through Xfig's fig2dev in S-Lang
sleepyhead (1.0.0-beta-2+dfsg-2+b1)
logiciel de suivi de sommeil avec un focus sur le traitement de surveillance CPAP
smalt (0.7.6-6)
Sequence Mapping and Alignment Tool
smalt-examples (0.7.6-6)
Sequence Mapping and Alignment Tool (examples)
smithwaterman (0.0+20160702-1+b1)
determine similar regions between two strings or genomic sequences
smrtanalysis (0~20161126)
software suite for single molecule, real-time sequencing
snakemake (3.10.0-1)
pythonic workflow management system
snap (2013-11-29-6)
location of genes from DNA sequence with hidden markov model
snap-aligner (1.0~beta.18+dfsg-1)
Scalable Nucleotide Alignment Program
snaphu (1.4.2-2) [non-free]
Statistical-Cost, Network-Flow Algorithm for 2D Phase Unwrapping
sniffles (1.0.2+ds-1)
structural variation caller using third-generation sequencing
snp-sites (2.3.2-1)
code binaire pour le paquet snp-sites
snpomatic (1.0-3+b1)
logiciel de mappage strict et rapide de « lectures courtes »
soapdenovo (1.05-3)
short-read assembly method to build de novo draft assembly
soapdenovo2 (240+dfsg1-2)
méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire un assemblage brouillon de novo
sortmerna (2.1-1+b1)
tool for filtering, mapping and OTU-picking NGS reads
spaced (1.0.2+dfsg-1+b1)
alignment-free sequence comparison using spaced words
spades (3.9.1+dfsg-1)
assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
spass (3.7-4)
démonstrateur automatique de théorème pour la logique du premier ordre avec égalité
spatialite-bin (4.3.0-2+b3)
extension géospatiale pour SQLite – outils
spd (1.3.0-1+b2)
Synchrotron image corrections and azimuthal integration
splash (2.6.0-2+b1)
Visualisation tool for Smoothed Particle Hydrodynamics simulation
sprai (0.9.9.22+dfsg-1)
single-pass sequencing read accuracy improver
spread-phy (1.0.7+dfsg-1)
analyze and visualize phylogeographic reconstructions
squizz (0.99c+dfsg-1)
convertisseur pour les séquences génétiques et les alignements
sra-toolkit (2.8.1-2+dfsg-2)
utilities for the NCBI Sequence Read Archive
srst2 (0.2.0-4)
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
ssake (3.8.4-1)
application de génomique pour assembler des millions de séquences très courtes d’ADN
ssake-examples (3.8.4-1)
example data for SSAKE, a genomic assembler of short reads
sspace (2.1.1+dfsg-2)
scaffolding pre-assembled contigs after extension
ssw-align (1.1-1+b1)
Smith-Waterman aligner based on libssw
stacks (1.44-2+b1)
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
stacks-web (1.44-2)
web interface for displaying loci from short-read sequences
staden (2.0.0+b11-2+b1)
DNA sequence assembly (Gap4/Gap5), editing and analysis tools
staden-common (2.0.0+b11-2)
Architecture independent files for Staden
staden-io-lib-examples (1.14.8-2)
programs for maniuplating DNA sequencing files (usage examples)
staden-io-lib-utils (1.14.8-2)
programs for maniuplating DNA sequencing files
stardata-common (0.8+b1)
cadriciel commun de gestion des paquets pour l’astronomie
starplot (0.95.5-8.2+deb9u1)
Un afficheur de carte stellaire en perspective 3D
starpu-contrib-examples (1.2.0+dfsg-4) [contrib]
Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs
starpu-examples (1.2.0+dfsg-4)
Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs
starpu-examples
paquet virtuel fourni par starpu-contrib-examples
stellarium (0.15.0-1+b1)
générateur de ciel photo-réaliste en temps réel
stellarium-data (0.15.0-1)
Stellarium data files
step (4:16.08.0-1+b1)
simulateur interactif pour la physique de KDE
stiff (2.4.0-2+b1)
convert scientific FITS images to the TIFF format
subread (1.5.1+dfsg-4)
toolkit for processing next-gen sequencing data
subread-data (1.5.1+dfsg-4)
data files for subread package
suitename (0.3.070628-1+b1)
categorize each suite in an RNA backbone
sumaclust (1.0.20-1+b1)
fast and exact clustering of genomic sequences
sumatra (1.0.20-1+b1)
fast and exact comparison and clustering of sequences
sumo (0.28.0+dfsg1-1)
Simulation of Urban MObility (SUMO)
surankco (0.0.r5+dfsg-1)
Supervised Ranking of Contigs in de novo Assemblies
survex (1.2.30-1)
logiciel de relevé et de cartographie de grotte
survex-aven (1.2.30-1)
visionneur de levé de grotte sophistiqué pour Survex
swarm (2.1.12+dfsg-1)
robust and fast clustering method for amplicon-based studies
swarp (2.38.0+dfsg-3+b1)
Resample and co-add together FITS images
swarp
paquet virtuel fourni par suckless-tools
swe-basic-data (1.80.00.0002-1)
basic data files for the libswe package
swe-standard-data (00004-1)
standard data for the Swiss Ephemeris
synphot-data (0.9.8.5+dfsg-1) [contrib]
Optional data files for pysynphot
syrthes (4.3.0-dfsg1-2)
simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide
syrthes-gui (4.3.0-dfsg1-2)
simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – interface graphique
syrthes-tests (4.3.0-dfsg1-2)
cas à tester pour SYRTHES
syrthes-tools (4.3.0-dfsg1-2)
simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – outils
t-coffee (11.00.8cbe486-5)
alignement multiple de séquences
t-coffee-examples (11.00.8cbe486-5)
exemples annotés pour l'utilisation de T-Coffee
tabix (1.3.2-2)
indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations
tandem-mass (1:20151215-4+b1)
mass spectrometry software for protein identification
tantan (13-4)
masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences
tcd-utils (20061127-2+b2)
convertisseur de fichiers TCD (Tide Constituent Database)
terraintool (1.12a-1)
Generates survex format terrain models from SRTM and ASTER data
tessa (0.3.1-6.2)
Simulation de systèmes optiques 3D avec la méthode FDTD
tessa-mpi (0.3.1-6.2)
simulation of 3D optical systems using FDTD on MPI clusters
therion (5.3.16-10+b4)
levé de cavité souterraine – logiciel de dessin en 2D et 3D
therion-viewer (5.3.16-10+b4)
Cave surveying - 3D viewer for therion models
theseus (3.3.0-5+b1)
superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance
theseus-examples (3.3.0-5)
superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance – exemples
tigr-glimmer (3.02b-1)
Détection de gènes dans des archées et des bactéries
timbl (6.4.8-1+b1)
apprentissage automatique – Tilburg Memory Based Learner
timblserver (1.11-1+b1)
extensions de serveur pour TiMBL
tksao (7.5+repack1-2)
Tk widgets for astronomical imaging and data visualization
tm-align (20160521+dfsg-2)
alignement structurel de protéines
tophat (2.1.1+dfsg-2+b2)
fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
toppred (1.10-4)
transmembrane topology prediction
transcalc (0.14-6)
calculateur de ligne de transmission RF et micro-ondes
transdecoder (3.0.1+dfsg-1)
find coding regions within RNA transcript sequences
transrate-tools (1.0.0-1+b1)
assistant pour Transrate
transtermhp (2.09-3+b1)
trouve les terminateurs de transcription dans les génomes bactériens
travis (161013-1)
analyse et visualisation de trajectoires
tree-ppuzzle (5.2-8+b3)
Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum
tree-puzzle (5.2-8+b3)
reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale
treeview (1.1.6.4+dfsg1-2)
réimplémentation en Java de TreeView de Michael Eisen
treeviewx (0.5.1+20100823-4)
affiche et imprime les arbres phylogénétiques
triangle-bin (1.6-2) [non-free]
High-quality 2-D mesh generator binary programs
trimmomatic (0.36+dfsg-1)
outil flexible de découpage de lecture pour les données Illumina NGS
trinityrnaseq (2.2.0+dfsg-2+b1)
assemblage de novo de séquences d’Arn
trinityrnaseq-examples (2.2.0+dfsg-2)
assemblage de novo de séquences d’Arn – fichiers de test et d’exemple
tunnelx (20160713-3)
logiciel pour le levé de caverne
twms (0.05t-4)
minuscule service de cartographie web
ubertooth (2015.09.R2-4)
plateforme de développement pour sans fil 2,4 GHz et pour expérimentation Bluetooth
ubertooth-firmware (2015.09.R2-4)
micrologiciels pour Ubertooth
ubertooth-firmware-source (2015.09.R2-4)
code source du micrologiciel d’Ubertooth
uc-echo (1.12-9+b1)
algorithme de correction d'erreurs pour les lectures courtes réalisées à partir de NGS
ucto (0.9.6-1)
analyseur lexical pour Unicode
uctodata (0.4-1)
fichiers de données pour Ucto
ugene (1.25.0+dfsg-1) [non-free]
integrated bioinformatics toolkit
ugene-data (1.25.0+dfsg-1) [non-free]
required data for UGENE - integrated bioinformatics toolkit
uhd-host (3.9.5-2+b3)
pilote matériel universel pour les produits Ettus Research – applications hôtes
units-filter (3.7-3)
analyseur d'expressions concernant des valeurs physiques
v-sim (3.7.2-2)
visualisation de structures atomiques
v-sim-common (3.7.2-2)
visualisation de structures atomiques – fichiers de prise en charge
v-sim-plugins (3.7.2-2)
greffons pour V_Sim (paquet de visualisation 3D)
varna (3-93+ds-1)
appliquette de visualisation d’ARN
varscan (2.4.3+dfsg-1) [non-free]
variant detection in next-generation sequencing data
vcftools (0.1.14+dfsg-4+deb9u1)
ensemble d'outils pour travailler avec les fichiers VCF
velvet (1.2.10+dfsg1-3+b1)
assembleur de séquences d'acides nucléiques pour de très courtes lectures
velvet-example (1.2.10+dfsg1-3)
données d’exemples pour l’assembleur génomique Velvet
velvet-long (1.2.10+dfsg1-3+b1)
assembleur de séquences d’acide nucléique pour des très courtes lectures, version longue
velvet-tests (1.2.10+dfsg1-3)
données de test pour l’assembleur de séquences Velvet
velvetoptimiser (2.2.5-5)
optimisation automatique de paramètres pour Velvet, assembleur génomique de type de novo
veusz (1.21.1-1.1)
application scientifique de tracé de résultats en 2D avec interface graphique
veusz-helpers (1.21.1-1.1)
modules d’assistance spécifiques aux architectures pour Veusz
viewmol (2.4.1-24+b1)
interface graphique pour les programmes de calculs de chimie
visp-images-data (3.0.0-2)
bibliothèque pour asservissement visuel – ensembles de données de référence
vistrails (2.2.4-1)
boîte à outils de visualisation de flux de travail scientifique
vmtk (1.3+dfsg-2.1+deb9u1) [non-free]
the Vascular Modeling Toolkit
votca-csg (1.3.0-3+b1)
moteur pour grosses granularités de VOTCA
votca-csg-scripts (1.3.0-3)
scripts pour grosses granularités de VOTCA
votca-csg-tutorials (1.3.0-3)
tutoriels pour grosses granularités de VOTCA
voxbo (1.8.5~svn1246-2+b3)
traitement, analyse statistique et affichage de données d’imagerie cérébrale
vsearch (2.3.4-1)
outil pour le traitement de séquences métagénomiques
wcslib-tools (5.16-1)
Command line tools utilizing wcslib
wcstools (3.9.4-2+b1)
Handle the WCS of a FITS image
weightwatcher (1.12-1+b1)
association de cartes et polygones pour le traitement d’images astronomiques
weka (3.6.14-1)
algorithmes d'apprentissage automatique pour l’exploration de données
wfrog (0.8.2+svn973-1)
logiciel web personnalisable pour stations météo
wigeon (20101212+dfsg1-1)
réimplémentation de l'utilitaire de détection d'anomalies de l'ADN 16S Pintail
wise (2.4.1-19)
comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines
wsclean (2.2.1-1)
Fast generic widefield interferometric imager
wxastrocapture (1.8.1+git20140821+dfsg-1+b2)
Windows linuX Astronomy Capture
xbs (0-10+b1)
modèles 3D et animations de molécules
xcrysden (1.5.60-1+b2)
visualisation de structure cristalline et moléculaire
xcrysden-data (1.5.60-1)
visualisation de structure cristalline et moléculaire – fichiers de données
xdrawchem (2.0-6)
éditeur de structures chimiques et de réactions
xflr5 (6.09.06-2+b3)
outil d'analyse pour les profils aérodynamiques
xfoil (6.99.dfsg-2+b1)
programme d’analyse et de conception de profil d'élément aérodynamique subsonique
xmakemol (5.16-9+b1)
programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires
xmakemol-gl (5.16-9+b1)
programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires – OpenGL
xmds2 (2.2.2+dfsg-3)
simulateur extensible multidimensionnel
xpa-tools (2.1.18-1+b1)
outils pour une communication ininterrompue entre des programmes Unix
xplot (1.19-9+b2)
simple traceur de données en coordonnées cartésiennes sur un écran
xplot-xplot.org (0.90.7.1-3)
Outil rapide pour tracer et visualiser de nombreuses données
xppaut (6.11b+1.dfsg-1+b2)
résolution de différentes sortes d’équation avec Phase Plane Plus Auto
xtide (2.13.2-1+b3)
prévisions des courants et marées
xtide-coastline (20020202-1)
données de littoral pour xtide
xtide-data (20100529-1)
données d’harmoniques pour xtide
xtide-data-nonfree (20100529-1) [non-free]
Harmonics data for xtide (Canada, Netherlands, Germany and UK)
xyscan (3.33-1+b1)
pilleur de données pour les scientifiques
yade (2017.01a-8)
plateforme pour la modélisation d'élément discret
yagv (0.4~20130422.r5bd15ed+dfsg-1)
encore un autre visionneur de G-code
yale (5.0.95-2) [non-free]
stellar data set from the Yale Bright Star Catalog
yorick (2.2.04+dfsg1-6+b1)
langage interprété et graphiques scientifiques
yorick-av (0.0.4-2~deb9u1)
production de vidéos dans divers formats depuis Yorick
yorick-cubeview (2.2-2)
afficheur de données 3D FITS spécialisé en imagerie spectrale
yorick-curses (0.1-6+b1)
Interface avec la bibliothèque (n)curses pour le langage Yorick
yorick-data (2.2.04+dfsg1-6)
bibliothèque interprétée pour le langage Yorick
yorick-dev (2.2.04+dfsg1-6+b1)
fichiers de développement pour le langage interprété Yorick
yorick-full (2.2.04+dfsg1-6+b1)
installation complète de l'interprèteur Yorick et ses greffons
yorick-gl (1.1+cvs20070922+dfsg-6.1)
gestion graphique OpenGL 3D pour le langage Yorick
yorick-gy (0.0.5-1)
introspection GObject et interfaces Gtk pour Yorick
yorick-gyoto (1.2.0-2)
General relativistic geodesic integration for the Yorick language
yorick-hdf5 (0.8.0-8)
Interface avec le format de fichiers HDF5 pour le langage Yorick
yorick-imutil (0.5.7-3)
routines de manipulations d'images rapides pour le langage Yorick
yorick-mira (1.1.0+git20170124.3bd1c3~dfsg1-2)
reconstruction d'image d'interferométrie optique avec Yorick
yorick-ml4 (0.6.0-3)
prise en charge du format de fichier Matlab pour le langage Yorick
yorick-mpeg (0.1-3)
gestion de la sortie MPEG pour le langage Yorick
yorick-mpy-common (2.2.04+dfsg1-6)
Message Passing Yorick - fichiers communs
yorick-mpy-mpich2 (2.2.04+dfsg1-6+b1)
Message Passing Yorick - basé sur MPICH2
yorick-mpy-openmpi (2.2.04+dfsg1-6+b1)
Message Passing Yorick - basé sur OpenMPI
yorick-optimpack (1.3.2+dfsg+1.4.0-1)
optimization of large scale problems for the Yorick language
yorick-soy (1.4.0-3)
opérations sur les matrices creuses pour le langage Yorick
yorick-spydr (0.8.2-3)
analyse simple et affichage d’image FITS
yorick-svipc (0.16-2+b2)
communication interprocessus pour Yorick — mémoire partagée…
yorick-yao (5.4.0-1)
simulation de système d’optique adaptative basé sur Yorick
yorick-yeti (6.4.0-1)
module utilitaire pour le langage Yorick
yorick-yeti-fftw (6.4.0-1)
greffon FFT pour le langage Yorick
yorick-yeti-regex (6.4.0-1)
expressions rationnelles POSIX pour le langage Yorick
yorick-yeti-tiff (6.4.0-1)
lecture du format d’image TIFF pour le langage Yorick
yorick-ygsl (1.2.1-1)
greffon pour des fonctions GSL spéciales, pour le langage Yorick
yorick-ynfft (1.0.3-1)
transformation de Fourier rapide non uniforme pour Yorick
yorick-yutils (1.5.2-1)
divers utilitaires pour le langage Yorick
yorick-z (1.2.0+cvs20080115-5+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips, mipsel, ppc64el, s390x], 1.2.0+cvs20080115-5+b1 [mips64el])
prise en charge de zlib, jpeg et png par le langage Yorick
z3 (4.4.1-1~deb9u1)
justificateur de théorème de Microsoft Research
z88 (13.0.0+dfsg2-4+b1)
programme d'analyse d'éléments finis - exécution
z88-data (13.0.0+dfsg2-4)
programme d'analyse d'éléments finis - données
zalign (0.9.1-2+b3)
alignement parallèle local de séquences biologiques
zegrapher (3.0-2)
tracé de courbes planes pour des fonctions et des suites mathématiques
zimpl (3.3.2-1+b1)
langage de modélisation mathématiques pour les problèmes d'optimisation
ztex-bmp (20120314-2)
analyseur universel de macro