Paquet source : sga (0.10.15-4)
Liens pour sga
Ressources Debian :
Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- sga
- de novo genome assembler that uses string graphs
Autres paquets associés à sga
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- adep:
debhelper
(>= 11~)
- programmes assistants pour debian/rules
-
- adep:
libsparsehash-dev
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
-
- adep:
zlib1g-dev
- bibliothèque de compression — paquet de développement
- ou
libz-dev
- paquet virtuel fourni par
zlib1g-dev
-
- adep:
libbamtools-dev
- API C++ de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
-
- adep:
gawk
- GNU awk, langage de recherche de motif et de traitement
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- adep:
help2man
- Générateur automatique de pages de manuel
-
- adep:
samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
-
- adep:
python
- langage interactif de haut niveau orienté objet (version Python2)
-
- adep:
python-ruffus
- Python computation pipeline library widely used in bioinformatics
-
- adep:
python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
