Paquet source : ariba (2.14.6+ds-1)
Liens pour ariba
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Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- ariba
- identification de résistance antibiotique par assemblage
Autres paquets associés à ariba
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- adep:
debhelper-compat
(= 13)
- Paquet indisponible
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- adep:
dh-python
- outils d’assistance pour Debian pour empaqueter les bibliothèques et applications Python
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- adep:
python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- adep:
python3-all-dev
- package depending on all supported Python 3 development packages
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- adep:
python3-dendropy
- DendroPy Phylogenetic Computing Library (Python 3)
-
- adep:
python3-setuptools
- Améliorations de Python3 Distutils
-
- adep:
python3-pymummer
(>= 0.10.2)
- Python 3 interface to MUMmer
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- adep:
python3-pysam
(>= 0.9.1)
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- adep:
python3-nose
(>= 1.3)
- test discovery and running for Python3 unittest
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- adep:
python3-bs4
- error-tolerant HTML parser for Python 3
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- adep:
python3-matplotlib
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3
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- adep:
python3-tk
- Tkinter –⋅écriture d'applications Tk avec Python⋅3.x
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- adep:
bowtie2
(>= 2.1.0)
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- adep:
cd-hit
- suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
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- adep:
mash
- estimation rapide de distance entre génomes et métagénomes utilisant MinHash
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- adep:
libminimap-dev
- development headers for libminimap
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- adep:
libfml-dev
(>= 0.1-4~)
- development headers for libfml
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- adep:
mummer
- Alignement de séquence efficace de génomes complets
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- adep:
fastaq
(>= 3.12.0)
- outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
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- adep:
help2man
- Générateur automatique de pages de manuel
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- adep:
asciidoctor
- rendu AsciiDoc en HTML pour ruby
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- adep:
spades
[amd64]
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
