Paquet source : roary (3.13.0+dfsg-1)
Liens pour roary
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Responsables :
Ressources externes :
Les paquets binaires suivants sont compilés à partir de ce paquet source :
- roary
- pipeline de pangénome autonome et très rapide
Autres paquets associés à roary
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- adep:
debhelper
(>= 12~)
- programmes assistants pour debian/rules
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- adep:
dh-dist-zilla
- debhelper add-on to call dzil build and clean up after the build
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- adep:
libdist-zilla-plugin-podweaver-perl
- Dist::Zilla plugin to use Pod::Weaver to generate Pod documentation
-
- adep:
bioperl
(>= 1.7.4)
- outils en Perl pour la bio-informatique
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- adep:
libarray-utils-perl
- collections de petits utilitaires pour la manipulation de tableaux
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- adep:
libenv-path-perl
- Perl module implementing advanced operations on path variables
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- adep:
libexception-class-perl
- module that allows you to declare real exception classes in Perl
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- adep:
libfile-find-rule-perl
- module to search for files based on rules
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- adep:
libfile-grep-perl
- module for pattern matching in a series of files
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- adep:
libfile-slurper-perl
- simple, sane and efficient module to slurp a file
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- adep:
libfile-which-perl
- Perl module for searching paths for executable programs
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- adep:
libfindbin-libs-perl
- Perl module to use a relative path for lib directories
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- adep:
libgraph-perl
- Perl module for graph data structures and algorithms
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- adep:
libgraph-readwrite-perl
- module for reading and writing directed graphs
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- adep:
liblog-log4perl-perl
- Perl port of the widely popular log4j logging package
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- adep:
libmoose-perl
- modern Perl object system framework
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- adep:
libperlio-utf8-strict-perl
- fast and correct UTF-8 Perl IO module
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- adep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
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- adep:
libtest-file-perl
- Perl module to test file attributes
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- adep:
libtest-files-perl
- module to ease testing with files and directories
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- adep:
libtest-output-perl
- perl module to test stdout and stderr messages
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- adep:
libtext-csv-perl
- comma-separated values manipulator (using XS or PurePerl)
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- adep:
bedtools
- suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
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- adep:
cd-hit
- suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
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- adep:
ncbi-blast+
- suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
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- adep:
mcl
- algorithme de Markov pour les grappes
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- adep:
parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel
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- adep:
prank
- Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
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- adep:
r-base-core
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
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- adep:
mafft
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
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- adep:
fasttree
- arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
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- idep:
perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
