Paquet : shapeit4 (4.2.2+dfsg-1 et autres)

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Ressources externes :

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fast and accurate method for estimation of haplotypes (phasing)

Segmented HAPlotype Estimation and Imputation Tools version 4 (SHAPEIT4). SHAPEIT4 is a fast and accurate method for estimation of haplotypes (aka phasing) for SNP array and sequencing data.

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dépendances

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enhances

dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

bibliothèque Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

bibliothèque d'options de programmes pour C++
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, arm64, ia64, loong64, sh4, x32]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, x32]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

librairie de compression au format XZ
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

trousse à outils SSL - bibliothèques partagées
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non arm64, x32]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

Bibliothèque de compression - binaires

sug: shapeit4-example

fast and accurate method for estimation of haplotypes (phasing) - example

Télécharger shapeit4

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b3	181,1 ko	729,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	4.2.2+dfsg-1+b3	202,7 ko	662,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	4.2.2+dfsg-1+b4	176,7 ko	598,0 ko	[liste des fichiers]
armel	4.2.2+dfsg-1+b3	169,8 ko	577,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	4.2.2+dfsg-1+b3	173,8 ko	417,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b2	191,1 ko	583,0 ko	[liste des fichiers]
i386	4.2.2+dfsg-1+b3	209,6 ko	681,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b2	246,3 ko	1 252,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b2	175,6 ko	600,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b2	191,1 ko	645,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	4.2.2+dfsg-1+b3	171,2 ko	756,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b2	188,4 ko	790,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	4.2.2+dfsg-1+b3	192,0 ko	726,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	4.2.2+dfsg-1+b3	189,7 ko	478,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	4.2.2+dfsg-1+b3	202,2 ko	662,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b2	243,8 ko	598,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b3	156,6 ko	1 052,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	4.2.2+dfsg-1+b3	214,6 ko	653,0 ko	[liste des fichiers]