Paquet : r-bioc-monocle (2.34.0-2 et autres)

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Ressources externes :

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Paquets similaires :

clustering, differential expression, and trajectory analysis for RNA-Seq

Monocle performs differential expression and time-series analysis for single-cell expression experiments. It orders individual cells according to progress through a biological process, without knowing ahead of time which genes define progress through that process. Monocle also performs differential expression analysis, clustering, visualization, and other useful tasks on single cell expression data. It is designed to work with RNA-Seq and qPCR data, but could be used with other types as well.

Autres paquets associés à r-bioc-monocle

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enhances

dep: libc6 (>= 2.11) [m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.2) [hppa]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.11) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non hppa, ia64, m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 11) [x32]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [hppa, ia64, m68k, sh4]

dep: libstdc++6 (>= 14) [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
dep: r-api-4.0

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Paquet indisponible
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, m68k, sh4]

Paquet indisponible
dep: r-api-bioc-3.20 [non hppa, ia64, m68k, sh4, x32]

paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
dep: r-bioc-biobase

fonctions de base pour Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocviews

Categorized views of R package repositories
dep: r-bioc-hsmmsinglecell (>= 0.101.5)

Single-cell RNA-Seq for differentiating human skeletal muscle myoblasts
dep: r-bioc-limma

modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)
dep: r-cran-cluster

paquet GNU R pour l'analyse de grappe, écrit par Rousseeuw et al.
dep: r-cran-combinat

GNU R package with utilities for combinatorics
dep: r-cran-ddrtree (>= 0.1.4)

étude à l’aide de GNU R de graphes principaux avec DDRTree
dep: r-cran-dplyr

GNU R grammar of data manipulation
dep: r-cran-fastica

paquet de GNU R pour ICA et la poursuite de projection
dep: r-cran-ggplot2 (>= 1.0.0)

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-igraph (>= 1.0.1)

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dep: r-cran-irlba (>= 2.0.0)

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GNU R and C/C++ Wrappers to Run the Leiden find_partition() Function
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paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley
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GNU R utility sparse matrix functions for quantitative language
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Make it easier to work with strings
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dep: r-cran-vgam (>= 1.0-6)

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GNU R package for color maps from matplotlib

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sug: r-cran-hmisc

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sug: r-cran-testthat

GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-monocle

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.34.0-2	1 482,9 ko	1 805,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.34.0-2	1 485,0 ko	1 766,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.34.0-2	1 482,1 ko	1 806,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	2.30.0-1	1 392,4 ko	1 662,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	2.30.0-1	1 396,8 ko	1 715,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	2.34.0-2	1 482,2 ko	1 804,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.30.0-1	1 380,3 ko	1 643,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.34.0-2	1 482,8 ko	1 810,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	2.34.0-2	1 485,8 ko	1 808,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.34.0-2	1 485,1 ko	1 806,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.34.0-2	1 483,9 ko	1 749,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	2.34.0-2	1 484,9 ko	1 766,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.30.0-1	1 396,1 ko	1 708,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	2.34.0-2	1 480,2 ko	2 705,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	2.26.0-2	1 389,6 ko	1 640,0 ko	[liste des fichiers]