Paquet : python3-htseq (2.0.5-1 et autres)

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Ressources externes :

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Paquets similaires :

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

This package contains the Python 3 module.

Autres paquets associés à python3-htseq

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el]
dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non x32]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 5) [x32]
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.13) [non x32]

dep: python3 (<< 3.9) [x32]

dep: python3 (>= 3.11~) [non x32]

dep: python3 (>= 3.8~) [x32]
dep: python3-numpy [x32]

gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [non x32]
dep: python3-numpy-abi9 [non x32]

paquet virtuel fourni par python3-numpy
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Télécharger python3-htseq

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.0.5-1	422,9 ko	2 164,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	2.0.5-1	477,5 ko	1 837,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	2.0.5-1	415,0 ko	1 836,0 ko	[liste des fichiers]
armel	2.0.5-1	411,3 ko	1 668,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	2.0.5-1	420,4 ko	1 276,0 ko	[liste des fichiers]
i386	2.0.5-1	475,3 ko	1 914,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	2.0.5-1	401,3 ko	1 652,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	2.0.5-1	378,0 ko	2 076,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	2.0.5-1	453,0 ko	2 156,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	2.0.5-1	471,9 ko	1 472,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	2.0.5-1	536,4 ko	1 622,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.11.3-1	268,1 ko	816,0 ko	[liste des fichiers]