Paquet : clustalw (2.1+lgpl-7) [debports]

Liens pour clustalw

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Introuvable

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [www.clustal.org]

Paquets similaires :

alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

Ce programme réalise l'alignement de séquences multiples de nucléotides ou d'acides aminés. Il identifie le format des séquences en entrée et détermine s'il s'agit d'acides nucléiques (ADN/ARN) ou d'acides aminés (peptides). Le format en sortie peut être choisi parmi divers formats pour les alignements multiples, comme Phylip ou FASTA. Clustal W est largement reconnu.

Les données en sortie de Clustal W peuvent être modifiées manuellement ou avec un éditeur d'alignement comme Seaview ou le logiciel compagnon Clustal X. Lorsqu'un modèle est construit à partir des alignements, il peut être utilisé pour améliorer les recherches dans les bases de données. Celles-ci peuvent être créées sous forme de modèles de Markov (HMM) avec le paquet HMMER.

Autres paquets associés à clustalw

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

sug: clustalx

alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
sug: seaview

interface multiplateforme pour l’alignement de séquences et la phylogénie

enh: bioperl-run

scripts d'enveloppe BioPerl
enh: emboss

ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
enh: t-coffee

alignement multiple de séquences

Télécharger clustalw

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64 (portage non officiel)	276,1 ko	982,0 ko	[liste des fichiers]