Paquet : seqmagick (0.8.6-2)

Liens pour seqmagick

Ressources Debian :

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Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

Autres paquets associés à seqmagick

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-pygtrie

bibliothèque de Python implémentant une structure de données trie – Python 3

Télécharger seqmagick

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	38,9 ko	212,0 ko	[liste des fichiers]