Paquet : freebayes (1.3.7-1)

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Paquets similaires :

détection bayésienne de polymorphismes basée sur les haplotypes et génotypage

FreeBayes est un détecteur de variant génétique bayésien conçu pour détecter des petits polymorphismes, plus spécialement les polymorphismes d'un seul nucléotide (SNP), les indels (insertions et suppressions), les polymorphismes de nucléotides multiples (MNP) et les évènements complexes (évènements d’insertion et de substitution composites), plus petits que la longueur d’un alignement de séquençage de lecture courte.

Autres paquets associés à freebayes

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.5)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg)

C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1)

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

rec: parallel

build and execute command lines from standard input in parallel

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