Paquet : libbio-db-hts-perl (3.01-4 et autres)

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Paquets similaires :

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Autres paquets associés à libbio-db-hts-perl

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libbio-perl-perl

modules Perl principaux de BioPerl
dep: libc6 (>= 2.4)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: perl (>= 5.38.2-3.2)

langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
dep: perlapi-5.38.2

paquet virtuel fourni par perl-base
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Bibliothèque de compression - binaires

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mips64el	3.01-4+b3	126,1 ko	542,0 ko	[liste des fichiers]