Paquet : artemis (18.2.0+dfsg-4)

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Paquets similaires :

navigateur de génome et outil d'annotation

Artemis est un navigateur de génome et un outil d'annotation qui permet de visualiser des caractéristiques de séquence, des données de nouvelle génération et les résultats d'analyses dans le contexte de la séquence, et la traduction six-frame de la séquence.

Ce paquet fournit le navigateur de génome Artemis, l'outil de comparaison Artemis (ACT) et les outils DNAplotter et BamView.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::java, interface::commandline, Interface utilisateur: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Champ d'application: Utilitaire, But: Analyse, use::comparing, use::editing, Fonctionne avec: Séquence biologique, Système X Window: Application

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dep: libbiojava-java (>= 1:1.9.5+dfsg)

Java API to biological data and applications (default version)
dep: libcglib-java (>= 3.3.0)

Code generation library for Java
dep: libcommons-lang3-java

Apache Commons Lang utility classes
dep: libcommons-logging-java (>= 1.3.0)

interface commune d'enveloppe pour plusieurs API de connexion
dep: libcommons-net-java

Apache Commons Net - Java client API for basic Internet protocols
dep: libhtsjdk-java

Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
dep: libibatis-java (>= 2.3.4.726)

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dep: libj2ssh-java (>= 0.2.9)

Java library for the SSH protocol
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dep: libpicard-java

Java library to manipulate SAM and BAM files
dep: libpostgresql-jdbc-java

Java database (JDBC) driver for PostgreSQL

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