Paquet : r-bioc-monocle (2.30.0-1) [debports]

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Paquets similaires :

clustering, differential expression, and trajectory analysis for RNA-Seq

Monocle performs differential expression and time-series analysis for single-cell expression experiments. It orders individual cells according to progress through a biological process, without knowing ahead of time which genes define progress through that process. Monocle also performs differential expression analysis, clustering, visualization, and other useful tasks on single cell expression data. It is designed to work with RNA-Seq and qPCR data, but could be used with other types as well.

Autres paquets associés à r-bioc-monocle

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dep: r-cran-igraph (>= 1.0.1)

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dep: r-cran-mass

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dep: r-cran-pheatmap

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dep: r-cran-plyr

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dep: r-cran-proxy

GNU R distance and similarity measures
dep: r-cran-qlcmatrix

GNU R utility sparse matrix functions for quantitative language
dep: r-cran-rann (>= 2.5)

Fast Nearest Neighbour Search Using L2 Metric
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dep: r-cran-reshape2

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dep: r-cran-viridis

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sug: r-bioc-scater

Single-Cell Analysis Toolkit for Gene Expression Data in R
sug: r-cran-hmisc

fonctions diverses de GNU R créées par Franck Harell
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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GNU R testsuite

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