Paquet : abyss (2.3.3-2) [debports]

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ABySS est un assembleur de séquences de novo parallèles conçu pour les lectures courtes. Il peut servir à assembler des données de séquences de génome ou de transcriptome. La parallélisation est permise par MPI, OpenMP et pthread.

Autres paquets associés à abyss

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: bsdextrautils

utilitaires supplémentaires de 4.4BSD-Lite
dep: libc6 (>= 2.32)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2~rc1)

high performance message passing library -- shared library
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

Bibliothèque partagée SQLite 3
dep: libstdc++6 (>= 11)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: make

utilitaire pour mener la compilation
dep: openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries
dep: openmpi-common

high performance message passing library -- common files
dep: perl

langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

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