Paquet : libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 et autres)

Liens pour libfastahack-dev

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source libfastahack :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

Étiquettes: Développement de logiciel: Bibliothèques, Rôle: Bibliothèque de programmation

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dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [ia64]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b1) [alpha, hppa, loong64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b2) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

Télécharger libfastahack-dev

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	28,5 ko	164,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	27,2 ko	117,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	25,5 ko	114,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	26,6 ko	105,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	26,5 ko	92,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,1 ko	96,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	28,8 ko	102,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11	33,3 ko	165,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	106,8 ko	1 190,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	26,6 ko	101,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	28,7 ko	136,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,1 ko	121,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	27,3 ko	119,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	78,2 ko	697,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	26,9 ko	117,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	29,5 ko	94,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	23,1 ko	108,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0.0+dfsg-11+b1	27,4 ko	99,0 ko	[liste des fichiers]