[ Paquet source : allelecount ]
Paquet : liballelecount-perl (4.3.0-3)
Liens pour liballelecount-perl
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source allelecount :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
interface Perl pour les algorithmes pour le compte de copies NGS
Ce paquet prend en charge le code des algorithmes de décompte de copies NGS. Il reçoit un fichier d'emplacements et un fichier [cr|b]am, puis génère un décompte de la couverture de chaque allèle (ACGT) à cet emplacement (avec des configurations de filtre données).
Le paquet allelecount existe essentiellement pour éviter la duplication de code entre certains autres projets, en particulier AscatNGS et Battenberg.
Ce paquet fournit l'interface Perl pour alleleCounter fournissant Sanger::CGP::AlleleCount::Genotype.
Autres paquets associés à liballelecount-perl
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- dep: libconst-fast-perl
- facility for creating read-only scalars, arrays, and hashes
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- dep: libdevel-cover-perl
- Perl tool for determining code coverage metrics
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- dep: libfile-slurp-perl
- single call read & write file routines
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- dep: libfile-which-perl
- Perl module for searching paths for executable programs
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- dep: libipc-system-simple-perl
- Perl module to run commands simply, with detailed diagnostics
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- dep: libjson-perl
- module for manipulating JSON-formatted data
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- dep: libpod-coverage-perl
- checker for comprehensiveness of perl module documentation
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- dep: libtest-fatal-perl
- module de test de code avec exceptions
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- dep: libtry-tiny-perl
- module fournissant un bloc try/catch minimaliste
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
Télécharger liballelecount-perl
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| all | 24,4 ko | 83,0 ko | [liste des fichiers] |