[ Paquet source : snpsift ]
Paquet : snpsift (5.1+dfsg2-3)
Liens pour snpsift
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source snpsift :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [pcingola.github.io]
Paquets similaires :
outil d’annotation et de manipulation de variations génomiques – outil
SnpSift est une boîte à outils qui permet de filtrer et de manipuler des fichiers annotés. Une fois que les variations génomiques ont été annotées, il est nécessaire de les filtrer pour trouver les « variations intéressantes ou pertinentes ». Étant donné l’importance des fichiers de données, cela n’est pas une tache triviale (par exemple, il n’est pas possible de charger toutes les variations dans une feuille de calcul XLS). SnpSift facilite cette manipulation de fichier VCF (Variant Call Format) et le filtrage nécessaire à cette étape dans les pipelines de traitement de données.
Ce paquet fournit l'outil en ligne de commande.
Autres paquets associés à snpsift
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- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
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- dep: libsnpsift-java (= 5.1+dfsg2-3)
- tool to annotate and manipulate genome variants - lib
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- sug: snpeff
- genetic variant annotation and effect prediction toolbox - tool
Télécharger snpsift
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| all | 4,4 ko | 15,0 ko | [liste des fichiers] |