Paquet : miniasm (0.3+dfsg-4) [debports]

Liens pour miniasm

Ressources Debian :

Rapports de bogues

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Introuvable

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées

Miniasm est un assembleur de novo très rapide basé sur OLC (Overlap-Layout- Consensus) pour des lectures longues bruitées. Il prend des auto-mappages de lectures « all-vs-all » (classiquement par mini-carte) comme entrée et produit des graphes d’assemblage au format GFA. Différent des assembleurs traditionnel, miniasm ne possède pas d’étape de consensus. Il concatène simplement des morceaux de séquences de lecture pour générer des séquences unitig. Par conséquent le taux d’erreur par base est similaire à celui des lectures brutes d’entrée.

Autres paquets associés à miniasm

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6.1 (>= 2.35)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

rec: minimap

correspondances approximatives de longues séquences biologiques telles que les lectures d’ADN

Télécharger miniasm

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ia64 (portage non officiel)	38,2 ko	113,0 ko	[liste des fichiers]