Paquet : gsort (0.1.4-3 et autres)

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Paquets similaires :

tri de données génomiques

gsort est un outil de tri pour des fichiers génomiques selon un fichier de génome. Par exemple, pour trier VCF pour avoir l’ordre suivant : X, Y, 2, 1, 3, ... et l’en-tête conservé au sommet.

Comme exemple plus probable, si un fichier doit être trié pour correspondre à l’ordre GATK (1 ... X, Y, MT), ce qui n’est pas possible avec les autres outils de réarrangement. Avec gsort, il est possible de placer MT comme le dernier chrom dans le fichier « .genome ».

Ce paquet est aussi utile pour préparer des fichiers pour des outils « bed ».

Autres paquets associés à gsort

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, loong64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]
dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

bibliothèque d'exécution pour les applications Go GNU

Télécharger gsort

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.1.4-3+b9	168,2 ko	806,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.1.4-3+b23	2 228,6 ko	6 715,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.1.4-3+b23	1 910,2 ko	6 268,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.1.4-3+b23	1 987,4 ko	6 609,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.1.4-3+b23	1 981,9 ko	6 609,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.1.4-3+b23	2 155,5 ko	6 554,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	0.1.4-3+b5	1 813,1 ko	6 181,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.1.4-3+b23	1 813,6 ko	7 374,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.1.4-3+b10	195,7 ko	1 123,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.1.4-3+b23	1 903,6 ko	6 523,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.1.4-3+b12	1 983,2 ko	6 395,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.1.4-3+b23	2 028,4 ko	7 035,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.1.4-3+b8	165,5 ko	1 257,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.1.4-3+b10	175,1 ko	703,0 ko	[liste des fichiers]