[ Paquet source : bcftools ]
Paquet : bcftools (1.22-1 et autres)
Liens pour bcftools
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bcftools :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Michael R. Crusoe (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [samtools.github.io]
Paquets similaires :
appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF
BCFtools est un ensemble d'outils qui manipulent des appels de variation dans le format « Variant Call Format » (VCF) et son équivalent binaire BCF. Toutes les commandes fonctionnent de façon transparente avec VCF et BCF, qu'ils soient compressés avec BGZF ou non.
Autres paquets associés à bcftools
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- dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, loong64, sh4]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libhts3t64 (>= 1.17) [ia64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
- dep: libhts3t64 (>= 1.22.1+ds-1) [non ia64]
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- dep: python3-gffutils [ia64]
- Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
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- dep: python3-matplotlib [ia64]
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab
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- dep: sse2-support [i386]
- CPU feature checking - require SSE2
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- rec: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- rec: python3-gffutils [non ia64]
- Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
-
- rec: python3-matplotlib [non ia64]
- système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab
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- sug: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- sug: python3-numpy
- bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3
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- sug: texlive-latex-recommended
- TeX Live : paquets recommandés pour LaTeX
Télécharger bcftools
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| alpha (portage non officiel) | 1.22-1 | 784,1 ko | 4 497,0 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 1.22-1 | 810,0 ko | 2 872,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 1.22-1 | 730,1 ko | 4 293,0 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 1.22-1 | 710,3 ko | 4 241,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 1.22-1 | 713,2 ko | 3 921,0 ko | [liste des fichiers] |
| hppa (portage non officiel) | 1.22-1 | 812,3 ko | 2 674,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 1.22-1 | 856,6 ko | 2 970,0 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 (portage non officiel) | 1.20-1 | 909,4 ko | 4 403,0 ko | [liste des fichiers] |
| loong64 (portage non officiel) | 1.22-1 | 772,6 ko | 4 407,0 ko | [liste des fichiers] |
| m68k (portage non officiel) | 1.22-1 | 718,9 ko | 2 505,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 1.22-1 | 742,5 ko | 4 562,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64 (portage non officiel) | 1.22-1 | 827,2 ko | 4 800,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 1.22-1 | 844,8 ko | 4 797,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 1.22-1 | 797,3 ko | 2 348,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 1.22-1 | 830,0 ko | 2 927,0 ko | [liste des fichiers] |
| sh4 (portage non officiel) | 1.22-1 | 863,7 ko | 4 117,0 ko | [liste des fichiers] |
| sparc64 (portage non officiel) | 1.22-1 | 779,2 ko | 44 486,0 ko | [liste des fichiers] |
| x32 (portage non officiel) | 1.22-1 | 804,7 ko | 2 670,0 ko | [liste des fichiers] |