Paquet : bcftools (1.20-1)

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Ressources externes :

Page d'accueil [samtools.github.io]

Paquets similaires :

appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF

BCFtools est un ensemble d'outils qui manipulent des appels de variation dans le format « Variant Call Format » (VCF) et son équivalent binaire BCF. Toutes les commandes fonctionnent de façon transparente avec VCF et BCF, qu'ils soient compressés avec BGZF ou non.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Rôle: Programme

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dépendances

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enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3-gffutils

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
dep: python3-matplotlib

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CPU feature checking - require SSE2
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

Bibliothèque de compression - binaires

rec: perl

langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

sug: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
sug: python3-numpy

gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3
sug: texlive-latex-recommended

TeX Live: LaTeX recommended packages

Télécharger bcftools

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	724,4 ko	4 292,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	742,1 ko	2 632,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	667,7 ko	4 035,0 ko	[liste des fichiers]
armel	657,0 ko	2 359,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	654,5 ko	1 824,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	758,3 ko	2 509,0 ko	[liste des fichiers]
i386	784,0 ko	2 728,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	909,4 ko	4 403,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	643,7 ko	2 246,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	676,3 ko	4 355,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	761,0 ko	4 583,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	777,7 ko	4 610,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	735,6 ko	2 184,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	766,4 ko	2 739,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	797,6 ko	3 854,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	726,2 ko	42 439,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	735,2 ko	2 434,0 ko	[liste des fichiers]