toutes les options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Paquet source : pal2nal  ]

Paquet : pal2nal (14.1-3)

Liens pour pal2nal

Screenshot

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source pal2nal :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

converts proteins to genomic DNA alignment

PAL2NAL is a program that converts a multiple sequence alignment of proteins and the corresponding DNA (or mRNA) sequences into a codon-based DNA alignment. The program automatically assigns the corresponding codon sequence even if the input DNA sequence has mismatches with the input protein sequence, or contains UTRs, polyA tails. It can also deal with frame shifts in the input alignment, which is suitable for the analysis of pseudogenes. The resulting codon-based DNA alignment can further be subjected to the calculation of synonymous (Ks) and non-synonymous (Ka) substitution rates.

Autres paquets associés à pal2nal

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger pal2nal

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
all 17,3 ko91,0 ko [liste des fichiers]