[ Paquet source : plasmidid ]
Paquet : plasmidid (1.6.5+dfsg-2)
Liens pour plasmidid
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source plasmidid :
- [plasmidid_1.6.5+dfsg-2.dsc]
- [plasmidid_1.6.5+dfsg.orig.tar.xz]
- [plasmidid_1.6.5+dfsg-2.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Steffen Moeller (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
mapping-based, assembly-assisted plasmid identification tool
PlasmidID is a mapping-based, assembly-assisted plasmid identification tool that analyzes and gives graphic solution for plasmid identification.
PlasmidID is a computational pipeline that maps Illumina reads over plasmid database sequences. The k-mer filtered, most covered sequences are clustered by identity to avoid redundancy and the longest are used as scaffold for plasmid reconstruction. Reads are assembled and annotated by automatic and specific annotation. All information generated from mapping, assembly, annotation and local alignment analyses is gathered and accurately represented in a circular image which allow user to determine plasmidic composition in any bacterial sample.
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Télécharger plasmidid
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| arm64 | 46,1 ko | 331,0 ko | [liste des fichiers] |