Paquet : apbs-doc (3.4.1-5.1)

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solveur adaptatif de Poisson Boltzmann

APBS est un paquet pour la résolution numérique de l'équation de Poisson-Boltzmann (PBE), un des modèles continus les plus populaires décrivant les interactions entre solutés moléculaires en milieu aqueux et salin. Le continuum électrostatique joue un rôle important dans plusieurs domaines de la simulation biomoléculaire, incluant :

 – la simulation des processus de diffusion pour déterminer les cinétiques
    de liaison ligand-protéine et protéine-protéine ;
 – la dynamique moléculaire de solvatation des biomolécules ;
 – le calcul de l'énergie de solvatation et de liaison pour déterminer
   les constantes d'équilibre de liaison ligand-protéine et
   protéine-protéine afin d'aider à la conception rationnelle de
   médicaments ;
 – les études de titration biomoléculaire.

APBS est conçu pour évaluer efficacement les propriétés électrostatiques pour de telles simulations dans un large spectre d'échelles de longueur pour permettre l'étude de molécules de dix à des millions d'atomes.

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rec: apbs

solveur adaptatif de Poisson Boltzmann

sug: python3-apbslib

Adaptive Poisson Boltzmann Solver

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