[ Paquet source : r-bioc-rsamtools ]
Paquet : r-bioc-rsamtools (2.18.0+dfsg-1 et autres)
Liens pour r-bioc-rsamtools
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-rsamtools :
- [r-bioc-rsamtools_2.18.0+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-rsamtools_2.18.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-rsamtools_2.18.0+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
Ce paquet fournit une interface pour les utilitaires samtools, bcftools et tabix pour la manipulation de fichiers SAM (Sequence Alignment/Map), BCF (binary variant call) et tabix compressés (indexed tab-delimited).
Autres paquets associés à r-bioc-rsamtools
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libcurl4t64 (>= 7.18.0)
- bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec OpenSSL
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- librairie de compression au format XZ
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.18
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
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- dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
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- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
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- dep: r-cran-bitops
- GNU R package implementing bitwise operations
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-genomicalignments
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
-
- sug: r-bioc-shortread (>= 1.19.10)
- GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
Télécharger r-bioc-rsamtools
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.18.0+dfsg-1+b1 | 3 500,1 ko | 5 581,0 ko | [liste des fichiers] |