Paquet : ssw-align (1.2.5-1) [debports]

Liens pour ssw-align

Ressources Debian :

Rapports de bogues

Télécharger le paquet source :

Introuvable

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

aligneur Smith-Waterman basé sur libssw

Ce paquet fournit un logiciel d’alignement en ligne de commande basé sur la bibliothèque libssw, une implémentation SIMD (Single Instruction on Multiple Data) accéléré de l’algorithme Smith-Waterman. Les fichiers d’entrée peuvent être aux formats FASTA ou FASTQ. À la fois les fichiers de cible et de requête peuvent contenir plusieurs séquences. Chaque séquence dans le fichier de requête sera alignée avec toutes les séquences dans le fichier de cible. La sortie est fournie au format texte de type SAM ou BLAST.

Autres paquets associés à ssw-align

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6.1 (>= 2.37)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libssw1 (= 1.2.5-1)

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger ssw-align

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ia64 (portage non officiel)	26,8 ko	77,0 ko	[liste des fichiers]