Paquet : r-cran-spp (1.15.5-1)

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R package for anlaysis of ChIP-seq and other functional sequencing data

 * Assess overall DNA-binding signals in the data and select appropriate
   quality of tag alignment.
 * Discard or restrict positions with abnormally high number of tags.
 * Calculate genome-wide profiles of smoothed tag density and save them
   in WIG files for viewing in other browsers.
 * Calculate genome-wide profiles providing conservative statistical
   estimates of fold enrichment ratios along the genome. These can be
   exported for browser viewing, or thresholded to determine regions of
   significant enrichment/depletion.
 * Determine statistically significant point binding positions
 * Assess whether the set of point binding positions detected at a
   current sequencing depth meets saturation criteria, and if does not,
   estimate what sequencing depth would be required to do so.

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enhances

dep: libbz2-1.0

Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [non armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: r-api-3.5

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-base-core (>= 3.5.1-1)

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
dep: r-bioc-rsamtools

importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
dep: r-cran-catools

GNU R package providing various utility functions
dep: r-cran-rcpp

GNU R package for Seamless R and C++ Integration
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger r-cran-spp

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	314,3 ko	448,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	309,3 ko	424,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	307,1 ko	387,0 ko	[liste des fichiers]
i386	320,9 ko	454,0 ko	[liste des fichiers]