Paquet : iva (1.0.9+ds-6)

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Paquets similaires :

assemblage itératif de séquences virales

IVA est un programme d’assemblage de novo conçu pour assembler des génomes de virus n’ayant pas de séquences répétées, utilisant des paires lues par Illumina séquencées à partir de populations mélangées à une profondeur extrêmement élevée.

L’algorithme principal d’IVA fonctionne en étendant de manière itérative des contigs utilisant des paires lues alignées. Son entrée peut être simplement des paires lues ou, en outre, un ensemble de contigs existants peut être fourni pour être étendu. Alternativement, il peut prendre des lectures avec une séquence de référence.

Étiquettes: Biologie: Acides nucléiques, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, implemented-in::python, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: role::program, works-with::biological-sequence, Fonctionne avec: Fichiers

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	8 377,1 ko	8 766,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	8 377,1 ko	8 766,0 ko	[liste des fichiers]