Paquet : zalign (0.9.1-4)

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Paquets similaires :

alignement parallèle local de séquences biologiques

zAlign est un aligneur local de séquences, spécialement conçu pour de grosses séquences d'ADN biologique, avec plus de 1Mdp (millions de paires de base). Il utilise l'algorithme exact Smith-Waterman avec une fonction affine « gap cost » pour cette tâche.

zAlign peut être utilisé dans des environnements simples ou distribués (dans des grappes par exemple). Il est actuellement testé sous Linux et Sun Solaris, en utilisant les implémentations MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) et OpenMPI (http://www.open-mpi.org/). Des portages vers d'autres environnements Unix sont envisagés.

Autres paquets associés à zalign

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libopenmpi3

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 4.9)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	44,7 ko	263,0 ko	[liste des fichiers]