Paquet : tabix (1.9-12~deb10u1)

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Paquets similaires :

indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations

Tabix indexe des fichiers où certaines colonnes indiquent les coordonnées de séquence : nom (habituellement un chromosome), départ et fin. Le fichier de données d'entrée doit être trié en fonction du positionnement et compressé par bgzip (fourni dans ce paquet), qui a une interface similaire à celle de gzip. Après indexation, tabix est en mesure de récupérer rapidement les lignes de données par coordonnées chromosomiques. La récupération rapide des données fonctionne aussi sur le réseau si une URI est donnée comme nom de fichier.

Cette version de Tabix a été compilée à partir du code source de HTSlib.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Rôle: Programme, Sciences: science::calculation, use::calculating, Format pris en charge: HTML, Hypertext Markup Language, Fonctionne avec: Texte

Autres paquets associés à tabix

dépendances

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enhances

dep: libbz2-1.0

Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
dep: libc6 (>= 2.17)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS
dep: libdeflate0 (>= 1.0)

compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

librairie de compression au format XZ
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

trousse à outils SSL - bibliothèques partagées
dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

Bibliothèque de compression - binaires

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	265,5 ko	883,0 ko	[liste des fichiers]