[ Paquet source : r-bioc-shortread ]
Paquet : r-bioc-shortread (1.48.0-2)
Liens pour r-bioc-shortread
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-shortread :
- [r-bioc-shortread_1.48.0-2.dsc]
- [r-bioc-shortread_1.48.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-shortread_1.48.0-2.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
This BioConductor module is a package for input, quality assessment, manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access to additional facilities for advanced statistical analysis, data transformation, visualization and integration with diverse genomic resources.
Autres paquets associés à r-bioc-shortread
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armhf]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.12
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
-
- dep: r-bioc-biobase
- fonctions de base pour Bioconductor
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
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- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
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- dep: r-bioc-rhtslib
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
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- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)
- importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-xvector
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
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- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
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- dep: r-cran-hwriter
- éditeur HTML – production d’objets de R au format HTML
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- dep: r-cran-lattice
- paquet GNU R pour les graphes « Trellis »
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- dep: r-cran-latticeextra
- paquet de GNU R d’affichages graphiques supplémentaires basés sur les treillis
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-biomart
- interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
Télécharger r-bioc-shortread
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| amd64 | 5 013,3 ko | 7 462,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 5 008,6 ko | 7 464,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 5 005,6 ko | 7 407,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 5 017,2 ko | 7 477,0 ko | [liste des fichiers] |