Paquet : python3-bx (0.8.9-1)

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Paquets similaires :

bibliothèque pour gérer des données génomiques et ses alignements

Le projet bx-python est une bibliothèque de Python 3 et un ensemble de scripts associés pour permettre une mise en œuvre rapide d’analyses à l’échelle du génome. La bibliothèque fournit divers modules utiles, mais les points forts sont :

 – des classes pour lire et travailler sur des alignements multiples locaux
   à l’échelle du génome (aux formats MAF, AXT et LAV) ;
 – une structure générique de données pour une indexation sur des fichiers
   du disque contenant des blocs de données associés avec des intervalles
   de séquences diverses (utilisée, par exemple, pour fournir un accès
   aléatoire à des alignements particuliers dans des fichiers énormes,
   optimisée pour une utilisation sur des systèmes de fichiers à travers
   le réseau) ;
 – « Binned bitsets » qui agissent juste comme des tableaux de bits pour
   un chromosome, mais allouent paresseusement des régions et permettent
   des blocs larges de bits définis ou non pour être stockés de manière
   compacte ;
 – « Intersecter » pour réaliser des tests rapides d’intersection qui
   préservent les intervalles de requête et de cible et l’annotation
   associée.

Autres paquets associés à python3-bx

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.11) [armhf, i386]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-lzo

Python bindings for the LZO data compression library (Python 3)
dep: python3-numpy

gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
dep: python3-six (>= 1.13.0)

bibliothèque de compatibilité Python⋅2 et⋅3 –⋅interface Python⋅3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger python3-bx

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 874,1 ko	4 619,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 831,0 ko	4 478,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 831,8 ko	3 959,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 890,6 ko	4 710,0 ko	[liste des fichiers]