Paquet : python3-pairtools-examples (0.3.0-2 et autres)

Liens pour python3-pairtools-examples

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source pairtools :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations:

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Autres paquets associés à python3-pairtools-examples

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

enh: python3-pairtools

Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment

Télécharger python3-pairtools-examples

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.3.0-2+b2	11,8 ko	50,0 ko	[liste des fichiers]