Paquet : r-bioc-scater (1.18.3+ds-4)

Liens pour r-bioc-scater

A collection of tools for doing various analyses of single-cell RNA-seq gene expression data, with a focus on quality control and visualization.

dep: r-api-4.0

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-api-bioc-3.12

paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
dep: r-bioc-biocgenerics

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocneighbors

Nearest Neighbor Detection for Bioconductor Packages
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-biocsingular

décomposition en valeurs singulières pour les paquets de Bioconductor
dep: r-bioc-delayedarray

BioConductor delayed operations on array-like objects
dep: r-bioc-delayedmatrixstats

fonctions pour les lignes et les colonnes des objets « DelayedMatrix »
dep: r-bioc-s4vectors

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-scuttle

BioConductor single-cell RNA-Seq analysis utilities
dep: r-bioc-singlecellexperiment

S4 Classes for Single Cell Data
dep: r-bioc-summarizedexperiment

BioConductor assay container
dep: r-cran-ggbeeswarm

tracé (diagramme en violon) de dispersion de points par catégorie avec GNU R
dep: r-cran-ggplot2

implementation of the Grammar of Graphics
dep: r-cran-gridextra

GNU R package with extensions for the grid package
dep: r-cran-matrix

paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
dep: r-cran-rlang

Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features
dep: r-cran-viridis

GNU R package for color maps from matplotlib

rec: r-bioc-destiny

GNU R diffusion maps
rec: r-bioc-dropletutils

BioConductor utilities for handling single-cell droplet data
rec: r-cran-nmf

GNU R framework to perform non-negative matrix factorization
rec: r-cran-pheatmap

GNU R package to create pretty heatmaps
rec: r-cran-rtsne

GNU R T-Distributed Stochastic Neighbor Embedding using a Barnes-Hut
rec: r-cran-testthat

GNU R testsuite
rec: r-cran-uwot

GNU R uniform manifold approximation and projection (UMAP)

sug: r-bioc-biobase

fonctions de base pour Bioconductor
sug: r-bioc-biocstyle

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-biomart

interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)
sug: r-cran-cowplot

GNU R streamlined plot theme and plot annotations for 'ggplot2'
sug: r-cran-knitr

GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown

convert R markdown documents into a variety of formats
sug: r-cran-robustbase

paquet de GNU R fournissant des statistiques de base robustes

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