[ Paquet source : r-bioc-genomicranges ]
Paquet : r-bioc-genomicranges (1.42.0+dfsg-1)
Liens pour r-bioc-genomicranges
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source r-bioc-genomicranges :
- [r-bioc-genomicranges_1.42.0+dfsg-1.dsc]
- [r-bioc-genomicranges_1.42.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [r-bioc-genomicranges_1.42.0+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
The ability to efficiently store genomic annotations and alignments is playing a central role when it comes to analyze high-throughput sequencing data (a.k.a. NGS data). The package defines general purpose containers for storing genomic intervals as well as more specialized containers for storing alignments against a reference genome.
Autres paquets associés à r-bioc-genomicranges
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.12
- paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.3)
- generic functions for Bioconductor
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- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
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- rec: r-bioc-annotate
- BioConductor annotation for microarrays
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- rec: r-bioc-summarizedexperiment
- BioConductor assay container
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- rec: r-cran-digest
- GNU R package for 'hash digest' of R data structures
-
- rec: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
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- sug: r-bioc-annotationdbi
- GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor
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- sug: r-bioc-annotationhub
- client GNU R pour accéder aux ressources d'AnnotationHub
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- sug: r-bioc-biobase
- fonctions de base pour Bioconductor
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- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
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- sug: r-bioc-biostrings (>= 2.25.3)
- GNU R string objects representing biological sequences
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- sug: r-bioc-bsgenome
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
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- sug: r-bioc-deseq2
- R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis
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- sug: r-bioc-dexseq
- GNU R inference of differential exon usage in RNA-Seq
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- sug: r-bioc-edger
- analyse empirique de données numériques d’expressions de gène avec R
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- sug: r-bioc-genomicalignments
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
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- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
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- sug: r-bioc-gviz
- Plotting data and annotation information along genomic coordinates
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- sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)
- importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
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- sug: r-bioc-rtracklayer
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
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- sug: r-bioc-variantannotation
- BioConductor annotation of genetic variants
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-matrix
- paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses
Télécharger r-bioc-genomicranges
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| mips64el | 1 809,4 ko | 2 679,0 ko | [liste des fichiers] |