Paquet : clustalx (2.1+lgpl-9)

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Page d'accueil [www.clustal.org]

Paquets similaires :

alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique

Ce paquet offre une interface graphique utilisateur pour le programme Clustal d'alignement de plusieurs séquences. Il fournit un environnement intégré pour effectuer plusieurs alignements par séquence et par profil pour analyser les résultats. L'alignement de séquences est affiché dans une fenêtre sur l'écran. Un système de coloration souple a été intégré pour mettre en évidence les caractéristiques conservées dans l'alignement. Pour les présentations professionnelles, il convient d'utiliser le paquet texshade (LaTeX) ou boxshade .

Les menus déroulants en haut de la fenêtre permettent de sélectionner toutes les options nécessaires pour les traditionnels alignements par séquences multiples et par profil. Vous pouvez couper-coller les séquences pour changer l'ordre de l'alignement ; vous pouvez sélectionner un sous-ensemble de séquences à aligner ; vous pouvez sélectionner une sous-plage de l'alignement à réaligner et réinsérer dans l'alignement original.

Une analyse de la qualité de l'alignement peut être réalisée et les segments à faible score ou les résidus exceptionnels peuvent être mis en évidence.

Étiquettes: Biologie: Clustal et ALN, Protéines, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Interface utilisateur: Graphical User Interface, interface::x11, role::program, Champ d'application: Utilitaire, Boîte à outils d'interface utilisateur: LessTif ou Motif, uitoolkit::qt, use::analysing, But: Comparaison, use::viewing, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire, Système X Window: Application

Autres paquets associés à clustalx

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [amd64, i386]

module principal de QT⋅5

dep: libqt5core5a (>= 5.7.0) [non amd64, i386]
dep: libqt5gui5 (>= 5.2.0)

module Qt⋅5 d'interface graphique

ou libqt5gui5-gles (>= 5.2.0)

Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
dep: libqt5widgets5 (>= 5.0.2)

module de widgets de Qt⋅5
dep: libqt5xml5 (>= 5.0.2)

Qt 5 XML module
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

sug: boxshade

Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
sug: clustalw

alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages

Télécharger clustalx

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	427,0 ko	1 342,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	369,7 ko	1 225,0 ko	[liste des fichiers]
armel	369,2 ko	1 209,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	384,9 ko	929,0 ko	[liste des fichiers]
i386	458,4 ko	1 389,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	385,7 ko	1 617,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	387,6 ko	1 556,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	418,9 ko	1 529,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	377,9 ko	1 353,0 ko	[liste des fichiers]