Paquet : python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

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Paquets similaires :

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Autres paquets associés à python3-cyvcf2

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

sortie colorée de terminal pour le module de connexion de Python 3
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
dep: python3-numpy-abi9

paquet virtuel fourni par python3-numpy

Télécharger python3-cyvcf2

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armhf	759,8 ko	4 482,0 ko	[liste des fichiers]