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[ Paquet source : tree-puzzle  ]

Paquet : tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-8)

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Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum

TREE-PUZZLE (le nouveau nom pour PUZZLE) est un programme interactif en console qui intègre un algorithme rapide de recherche par arborescence, sur 4 niveaux, qui permet l'analyse de grands jeux de données et qui fournit un support d'estimations à chaque branche interne. TREE-PUZZLE calcule aussi des distances maximales entre des paires semblables, ainsi que la longueur des branches spécifiées par les utilisateurs. Les branches peuvent aussi être calculées durant un temps donné. De plus, TREE-PUZZLE offre une nouvelle méthode, la cartographie par similitude, pour rechercher le support d'une hypothétique branche interne sans calculer l'arbre complet et pour visualiser l'enchaînement d'un alignement de séquence apparentées.

Ceci est la version parallélisée de tree-puzzle.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, use::comparing, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

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