[ Paquet source : insilicoseq ]
Paquet : insilicoseq (1.5.2-1)
Liens pour insilicoseq
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source insilicoseq :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Sao I Kuan (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
simulateur de séquençage produisant des lectures Illumina réalistes
Conçu au départ pour la simulation d’échantillons métagénomiques, il peut aussi être utilisé pour produire des données de séquençage pour un seul génome.
InSilicoSeq est écrit en Python et utilise l’estimation par la méthode du noyau de densité pour modéliser la qualité de lecture de données de séquençage réelles.
InSilicoSeq prend en charge la substitution, l’insertion et la suppression d’erreurs. Si l’utilisation de l’insertion et la suppression d’erreurs ne sont pas utiles, un modèle basique d’erreur est fourni.
Autres paquets associés à insilicoseq
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
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- dep: python3-future
- prise en charge d’un source unique pour Python 3 et 2 – Python 3.x
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- dep: python3-joblib
- tools to provide lightweight pipelining in Python
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- dep: python3-numpy
- gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
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- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
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- dep: python3-requests
- bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
Télécharger insilicoseq
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| all | 1 434,7 ko | 1 608,0 ko | [liste des fichiers] |