Paquet : sibelia (3.0.7+dfsg-3)

Liens pour sibelia

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source sibelia :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [bioinf.spbau.ru]

Paquets similaires :

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Autres paquets associés à sibelia

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: lagan

alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable
dep: libc6 (>= 2.4)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 9)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: python3

langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Télécharger sibelia

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mipsel	276,8 ko	1 261,0 ko	[liste des fichiers]