Paquet : relion (3.1.3-3 et autres)

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toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy

RELION (for REgularised LIkelihood OptimisatioN) is a stand-alone computer program for Maximum A Posteriori refinement of (multiple) 3D reconstructions or 2D class averages in cryo-electron microscopy.

RELION provides a GUI, several command-line tools in parallel (MPI) and serial versions, optionally with CUDA/GPU support.

relion provides the serial and parallel (MPI) command-line tools without CUDA/GPU support.

Autres paquets associés à relion

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.10)

bibliothèque de calcul des transformées de Fourier rapides — double précision
dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.10)

bibliothèque de calcul des transformées de Fourier rapides — simple précision
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 11)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libtiff6 (>= 4.0.3)

bibliothèque pour le format graphique TIFF (Tag Image File Format)
dep: openmpi-gcc

Paquet indisponible

ou openmpi-bin

high performance message passing library -- binaries

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mipsel	3.1.3-3+b1	10 214,2 ko	104 157,0 ko	[liste des fichiers]