Paquet : cassiopee (1.0.9-3 et autres)

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Paquets similaires :

outil d'indexation et de recherche dans les séquences génomiques

Cassiopee est une bibliothèque d'indexation et de recherche implémentée en C. Il s'agit d'une réécriture complète de la gemme ruby Cassiopee. Elle scanne une séquence génomique d'entrée (ADN, ARN, protéine) et recherche une sous-séquence avec une correspondance parfaite ou en permettant des substitutions (mesurées avec la distance de Hamming), des insertions ou des suppressions.

Ce paquet fournit les outils cassiopee et cassiopeeknife.

Autres paquets associés à cassiopee

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.4)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

bibliothèque mettant en œuvre des algorithmes de recherche
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgoogle-glog0v6 (>= 0.6.0~rc1)

library that implements application-level logging.
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mipsel	1.0.9-3+b2	17,4 ko	60,0 ko	[liste des fichiers]