Paquet : libnucleotidelikelihoodcore0 (1.10.4+dfsg-5)

implémentation de LikelihoodCore pour les nucléotides utilisée par beast-mcmc

BEAST est un programme multiplateforme pour l'analyse bayésienne MCMC de séquences moléculaires. Il est entièrement orienté vers les phylogénies à racine et mesurées dans le temps inférées avec des modèles d'horloge (« clock ») stricts ou relâchés. Il peut servir de méthode de reconstruction de phylogénies mais est également un environnement pour tester des hypothèses évolutionnaires sans poser de condition sur la topologie de l'arbre. BEAST utilise MCMC pour balancer la taille de l'arbre, afin que chaque arbre soit pondéré proportionnellement à sa probabilité postérieure. Une interface utilisateur simple à utilisée est incluse pour configurer les analyses standard, ainsi qu'une suite de programmes pour analyser les résultats.

Ce paquet fournit une implémentation de LikelihoodCore pour les nucléotides qui appelle des méthodes natives pour un maximum de rapidité.

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