Paquet : daligner (1.0+git20221215.bd26967-1)

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Paquets similaires :

alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

Ces outils permettent de trouver tous les alignements locaux significatifs parmi des lectures encodées dans une base de données Dazzler. L’hypothèse est que les lectures sont originaires d’un séquenceur à lectures longues RS II de Pacific Biosciences. C'est-à-dire que les lectures sont longues et bruitées, jusqu’à 15 % en moyenne.

Étiquettes: Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme

Autres paquets associés à daligner

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

sug: dascrubber

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
sug: dazzdb

manage nucleotide sequencing read data

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	228,0 ko	1 541,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	198,4 ko	1 863,0 ko	[liste des fichiers]
armel	188,8 ko	1 435,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	190,1 ko	1 059,0 ko	[liste des fichiers]
i386	220,7 ko	1 675,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	186,8 ko	1 972,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	199,5 ko	2 031,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	222,1 ko	2 057,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	204,7 ko	1 535,0 ko	[liste des fichiers]