Paquet : covtobed (1.3.5+dfsg-1 et autres)

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Paquets similaires :

conversion de « track » de couverture d’un fichier BAM dans un fichier BED

Ce paquet lit un ou plusieurs fichiers d’alignements (triés selon le format BAM) et produit des fichiers au format BED avec la couverture. Il joint des bases consécutives avec la même couverture et il peut être utilisé pour imprimer un fichier BED avec les régions ayant un intervalle de couverture particulier.

Autres paquets associés à covtobed

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: bamtools

boîte à outils de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)

bibliothèque dynamique de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
dep: libc6 (>= 2.34)

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: zlib1g

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger covtobed

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.3.5+dfsg-1+b1	48,8 ko	143,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.3.5+dfsg-1+b1	42,8 ko	147,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.3.5+dfsg-1+b1	41,7 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.3.5+dfsg-1+b1	43,1 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.3.5+dfsg-1+b1	51,5 ko	150,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.3.5+dfsg-1+b1	45,5 ko	217,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1.3.5+dfsg-1+b1	45,2 ko	215,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.3.5+dfsg-1+b1	48,4 ko	211,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.3.5+dfsg-1+b1	42,4 ko	143,0 ko	[liste des fichiers]